234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1586 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  99.09 
 
 
328 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  98.78 
 
 
328 aa  648    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  100 
 
 
328 aa  654    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  99.39 
 
 
328 aa  651    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  96 
 
 
325 aa  629  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  95.69 
 
 
325 aa  627  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  94.5 
 
 
327 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  94.5 
 
 
327 aa  624  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  94.82 
 
 
328 aa  624  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  95.08 
 
 
325 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  65.95 
 
 
330 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  64.98 
 
 
327 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  64.98 
 
 
327 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  65.72 
 
 
327 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  60.56 
 
 
325 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  57.55 
 
 
327 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  63.3 
 
 
334 aa  363  2e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  57.41 
 
 
329 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  57.78 
 
 
330 aa  354  1e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  60.75 
 
 
347 aa  354  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  60 
 
 
346 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  59.15 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  56.29 
 
 
339 aa  349  4e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  54.89 
 
 
354 aa  348  6e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  58.77 
 
 
354 aa  348  7e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  58.66 
 
 
354 aa  348  9e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  55.59 
 
 
328 aa  345  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  58.54 
 
 
354 aa  344  8.999999999999999e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  55.62 
 
 
329 aa  342  4e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  55.08 
 
 
344 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  58.82 
 
 
352 aa  332  4e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  61.18 
 
 
324 aa  329  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  57.54 
 
 
329 aa  329  4e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  55.21 
 
 
341 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  56.27 
 
 
341 aa  317  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  55.38 
 
 
353 aa  317  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  55.96 
 
 
341 aa  316  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  55.21 
 
 
341 aa  297  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  49.38 
 
 
331 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  46.65 
 
 
328 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  48.87 
 
 
329 aa  280  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  48.74 
 
 
338 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  46.3 
 
 
337 aa  277  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  49.68 
 
 
314 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  45.82 
 
 
320 aa  275  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  48.11 
 
 
328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  46.84 
 
 
328 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  47.77 
 
 
359 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  46.75 
 
 
323 aa  264  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  44.98 
 
 
325 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  43.79 
 
 
317 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  46.83 
 
 
321 aa  260  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  46.53 
 
 
325 aa  259  4e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  46.47 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  44.79 
 
 
317 aa  258  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  46.53 
 
 
321 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  46.53 
 
 
321 aa  258  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  46.67 
 
 
320 aa  257  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  46.67 
 
 
321 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
317 aa  256  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  47.19 
 
 
321 aa  256  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  46.22 
 
 
321 aa  256  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  46.67 
 
 
321 aa  256  3e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  47.19 
 
 
321 aa  256  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  50.36 
 
 
328 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  44.1 
 
 
317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  44.79 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  46.06 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  42.81 
 
 
322 aa  253  3e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  45.51 
 
 
317 aa  253  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  44.79 
 
 
322 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  44.79 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  44.79 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  44.79 
 
 
337 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  45.89 
 
 
313 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  47.27 
 
 
334 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  44.51 
 
 
316 aa  249  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  42.72 
 
 
321 aa  248  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  45.69 
 
 
321 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 
322 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  42.39 
 
 
321 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  42.81 
 
 
286 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  44.79 
 
 
324 aa  243  3.9999999999999997e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  46.96 
 
 
344 aa  243  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  45.95 
 
 
344 aa  241  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  43.93 
 
 
325 aa  239  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  44.79 
 
 
322 aa  239  5e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  42.57 
 
 
308 aa  238  8e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  44.79 
 
 
325 aa  238  1e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  44.13 
 
 
320 aa  238  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  45.71 
 
 
319 aa  237  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  40.79 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  45.05 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  43.17 
 
 
320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  41.18 
 
 
311 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  45.52 
 
 
311 aa  233  3e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  42.9 
 
 
318 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  43.6 
 
 
279 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  40.31 
 
 
319 aa  230  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  41.92 
 
 
320 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>