234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2086 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 354 aa  715    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  90.96 
 
 		 354 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  90.68 
 
 		 354 aa  629  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  90.06 
 
 		 354 aa  614  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  68.66 
 
 		 347 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  69.71 
 
 		 346 aa  462  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  67.07 
 
 		 330 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  71.95 
 
 		 329 aa  443  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  64.81 
 
 		 327 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  63.89 
 
 		 327 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  65.44 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  64 
 
 		 324 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  64.29 
 
 		 334 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  60.38 
 
 		 329 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  56.29 
 
 		 327 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  59.75 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  57.83 
 
 		 330 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  57.23 
 
 		 328 aa  368  1e-101  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  59.82 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  59.82 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  53.53 
 
 		 339 aa  369  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  59.38 
 
 		 325 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  59.69 
 
 		 325 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  55.56 
 
 		 329 aa  364  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  59.08 
 
 		 325 aa  363  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  58.77 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  59.08 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  59.08 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  59.08 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  58.59 
 
 		 328 aa  360  2e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  59.33 
 
 		 352 aa  358  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  53.23 
 
 		 354 aa  345  8.999999999999999e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  52.54 
 
 		 341 aa  328  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  52.54 
 
 		 341 aa  328  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  55.83 
 
 		 353 aa  324  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  46.94 
 
 		 338 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  52.19 
 
 		 344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  47.34 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  46.53 
 
 		 328 aa  308  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  46.85 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  51.65 
 
 		 341 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  45.17 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 320 aa  289  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  44.62 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  44.41 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  50.3 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  46.22 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  44.83 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  44.9 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  46.06 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  46.11 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  44.83 
 
 		 317 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  40.06 
 
 		 337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  49.83 
 
 		 314 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  45.48 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  45.69 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  47.77 
 
 		 308 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  43.45 
 
 		 306 aa  270  4e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  46.46 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  45.18 
 
 		 328 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  48.15 
 
 		 318 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  45.43 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  46.47 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  45.85 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  45.85 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  45.23 
 
 		 322 aa  266  2.9999999999999995e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  45.17 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  45.68 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  46.89 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  47.1 
 
 		 313 aa  266  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  45.68 
 
 		 321 aa  266  5e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  46.15 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  44.64 
 
 		 344 aa  266  5.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  46.15 
 
 		 322 aa  265  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  43.12 
 
 		 322 aa  265  7e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  45.54 
 
 		 321 aa  265  7e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  45.54 
 
 		 321 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  44.86 
 
 		 317 aa  265  8e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  45.79 
 
 		 320 aa  265  8e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  46.15 
 
 		 337 aa  265  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  45.79 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  46.15 
 
 		 322 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  45.79 
 
 		 321 aa  265  1e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  44.34 
 
 		 311 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  49.16 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  43.13 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  44.76 
 
 		 312 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  43.31 
 
 		 311 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  44.79 
 
 		 316 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  48.82 
 
 		 320 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  48.82 
 
 		 320 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  43.45 
 
 		 334 aa  260  3e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  42.01 
 
 		 310 aa  259  4e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  47.84 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  44.64 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  41.52 
 
 		 334 aa  257  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  41.76 
 
 		 335 aa  256  5e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  48.93 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  45.45 
 
 		 305 aa  253  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  45.17 
 
 		 322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>