217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1240 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 338 aa  668    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  77.74 
 
 		 359 aa  510  1e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  61.14 
 
 		 337 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  55.03 
 
 		 331 aa  328  7e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  51.27 
 
 		 330 aa  311  7.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  51.65 
 
 		 329 aa  310  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  50.62 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  52.37 
 
 		 320 aa  304  1.0000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  47.91 
 
 		 327 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  46.94 
 
 		 354 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  50.31 
 
 		 328 aa  295  6e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  48.52 
 
 		 354 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 328 aa  295  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  51.28 
 
 		 327 aa  294  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  47.23 
 
 		 354 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  47.65 
 
 		 354 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  48.9 
 
 		 346 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  50.93 
 
 		 328 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  48.24 
 
 		 316 aa  288  9e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  52.3 
 
 		 323 aa  288  9e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  49.36 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  52.73 
 
 		 325 aa  287  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  49.53 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  48.91 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 329 aa  285  7e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  48.04 
 
 		 354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  53.31 
 
 		 327 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  49.01 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  49.01 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  49.01 
 
 		 337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  50.65 
 
 		 318 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  50.53 
 
 		 352 aa  282  7.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  50.52 
 
 		 317 aa  281  1e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  47.8 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  48.68 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  48.86 
 
 		 322 aa  280  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  48.87 
 
 		 328 aa  280  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  56.87 
 
 		 314 aa  279  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  48.74 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  48.36 
 
 		 322 aa  278  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  48.03 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  48.03 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  48.03 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  48.03 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  48.03 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  48.03 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  48.03 
 
 		 321 aa  277  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  47.7 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  47.7 
 
 		 321 aa  276  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  48.73 
 
 		 327 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  48.73 
 
 		 327 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  48.43 
 
 		 328 aa  275  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  48.43 
 
 		 328 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  48.28 
 
 		 314 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  48.43 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  50.52 
 
 		 317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  46.6 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  46.3 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  46.41 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  48.62 
 
 		 334 aa  272  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  48.54 
 
 		 325 aa  271  9e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  48.87 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  47.8 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  47.74 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  44.76 
 
 		 321 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  48.54 
 
 		 325 aa  269  4e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  50.31 
 
 		 327 aa  269  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  53.53 
 
 		 313 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  48.26 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  50.7 
 
 		 313 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  50.77 
 
 		 327 aa  268  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  45.61 
 
 		 306 aa  267  2e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  47.9 
 
 		 318 aa  267  2e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  45.51 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  45.6 
 
 		 344 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  46.15 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  50.93 
 
 		 312 aa  266  4e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  43.65 
 
 		 310 aa  266  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  49.64 
 
 		 353 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  50 
 
 		 334 aa  265  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  48.34 
 
 		 321 aa  264  2e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  48.61 
 
 		 320 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  48.96 
 
 		 320 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  46.35 
 
 		 341 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  46.05 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  46.35 
 
 		 341 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  47.21 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  45.27 
 
 		 307 aa  262  6e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  48.26 
 
 		 320 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  50.76 
 
 		 321 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  47.04 
 
 		 311 aa  260  3e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  46.39 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  46.79 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  45.07 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  49.22 
 
 		 308 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  46.51 
 
 		 312 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  48.7 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  47.59 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>