240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4156 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 323 aa  638    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  79.23 
 
 		 325 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  61.9 
 
 		 320 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  64.54 
 
 		 325 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  61.27 
 
 		 325 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  61.13 
 
 		 317 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  61.13 
 
 		 317 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  59.35 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  54.87 
 
 		 322 aa  357  9.999999999999999e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  54.87 
 
 		 322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  54.87 
 
 		 322 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  54.87 
 
 		 322 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  54.87 
 
 		 337 aa  354  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  53.53 
 
 		 317 aa  348  7e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  52.98 
 
 		 321 aa  348  1e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  52.98 
 
 		 321 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  52.98 
 
 		 321 aa  347  1e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  52.98 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  52.98 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  52.98 
 
 		 320 aa  347  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  52.98 
 
 		 321 aa  347  2e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  53.53 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  54.22 
 
 		 321 aa  346  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  52.66 
 
 		 321 aa  345  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  55.66 
 
 		 334 aa  342  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  52.88 
 
 		 317 aa  340  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  56.29 
 
 		 327 aa  338  8e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  54.55 
 
 		 322 aa  338  8e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  56.29 
 
 		 327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  53.77 
 
 		 319 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  53.14 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  55.81 
 
 		 318 aa  333  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  55.94 
 
 		 315 aa  332  4e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  54.07 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  50.48 
 
 		 319 aa  322  6e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  50.16 
 
 		 320 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  53.75 
 
 		 328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  54.43 
 
 		 320 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  47.42 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  51.95 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  50.16 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  52.72 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  51.62 
 
 		 328 aa  289  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  52.3 
 
 		 338 aa  288  8e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  48.84 
 
 		 321 aa  287  2e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  50.32 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  51.11 
 
 		 321 aa  286  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  46.91 
 
 		 311 aa  285  7e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  48.46 
 
 		 308 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  48.71 
 
 		 329 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  51.13 
 
 		 318 aa  279  5e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  49.84 
 
 		 359 aa  279  5e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  49.68 
 
 		 330 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 306 aa  276  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  51.56 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  50.16 
 
 		 327 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 307 aa  275  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  44.84 
 
 		 310 aa  275  8e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  45.4 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  48.39 
 
 		 327 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  52.14 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  53 
 
 		 346 aa  272  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  53 
 
 		 347 aa  272  7e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  50 
 
 		 327 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  52 
 
 		 325 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  44.48 
 
 		 337 aa  271  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  51.05 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  48.56 
 
 		 312 aa  270  4e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  51.07 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  51.07 
 
 		 320 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  45.99 
 
 		 322 aa  267  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  48.12 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  47.06 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  47.06 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  47.06 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  47.83 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  47.83 
 
 		 327 aa  265  7e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  47.81 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  48.24 
 
 		 325 aa  264  1e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  49.84 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  46.75 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  47.81 
 
 		 354 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  52.45 
 
 		 334 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  48.31 
 
 		 354 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  49.32 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  45.86 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  46.41 
 
 		 322 aa  261  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  48.08 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  47.18 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  47.74 
 
 		 354 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  46.13 
 
 		 328 aa  258  9e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  46.98 
 
 		 305 aa  258  1e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  47.59 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  44.59 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  47.08 
 
 		 354 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  47.93 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  48.55 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  48.67 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  47.91 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>