236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3347 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 330 aa  645    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  67.37 
 
 		 354 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  67.07 
 
 		 354 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  68.63 
 
 		 327 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  67.28 
 
 		 354 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  68.01 
 
 		 327 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  69 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  66.98 
 
 		 354 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  68.39 
 
 		 346 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  64.83 
 
 		 329 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  70.09 
 
 		 334 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  69.04 
 
 		 327 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  63.38 
 
 		 327 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  66.56 
 
 		 325 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  66.67 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  66.67 
 
 		 327 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  65.45 
 
 		 329 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  66.26 
 
 		 325 aa  402  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  69.57 
 
 		 324 aa  401  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  66.35 
 
 		 330 aa  402  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  64.13 
 
 		 329 aa  401  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  66.56 
 
 		 325 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  66.26 
 
 		 328 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  66.26 
 
 		 328 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  66.26 
 
 		 328 aa  401  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  65.95 
 
 		 328 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  65.34 
 
 		 328 aa  396  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  62.88 
 
 		 325 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  59.88 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  60.86 
 
 		 328 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  60.75 
 
 		 352 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  60.58 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  58.33 
 
 		 353 aa  353  2e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  58.7 
 
 		 341 aa  349  3e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  58.7 
 
 		 341 aa  349  3e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  57.45 
 
 		 344 aa  347  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  56.76 
 
 		 341 aa  331  9e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  55.72 
 
 		 341 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  51.27 
 
 		 338 aa  311  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  50.95 
 
 		 359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  49.84 
 
 		 329 aa  302  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  47.44 
 
 		 328 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  50.46 
 
 		 325 aa  292  6e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  52.67 
 
 		 314 aa  291  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  50.31 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  47.94 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  48.31 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  50.16 
 
 		 320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  48.12 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  48.12 
 
 		 328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  50.32 
 
 		 325 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  45.71 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  45.95 
 
 		 337 aa  280  3e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  50.81 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  45.83 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  49.68 
 
 		 323 aa  276  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  45.19 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  47.04 
 
 		 317 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  46.03 
 
 		 317 aa  274  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  50.32 
 
 		 334 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  45.96 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  46.08 
 
 		 317 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  45.96 
 
 		 322 aa  270  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  45.96 
 
 		 337 aa  269  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  47.02 
 
 		 317 aa  268  8e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  46.58 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  46.58 
 
 		 321 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  45.65 
 
 		 322 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  45.65 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  46.27 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  46.27 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  46.27 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  46.27 
 
 		 320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  46.27 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  46.27 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  46.93 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  46.27 
 
 		 321 aa  266  4e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  45.77 
 
 		 316 aa  266  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  44.92 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  47.5 
 
 		 328 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  47.74 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  46.75 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  46.56 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  47.5 
 
 		 334 aa  258  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  46.58 
 
 		 325 aa  258  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  42.5 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  45.22 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  47.39 
 
 		 320 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  46.56 
 
 		 319 aa  256  4e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  41.56 
 
 		 320 aa  253  3e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  40.38 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  47.54 
 
 		 344 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  41.29 
 
 		 311 aa  252  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  47.37 
 
 		 320 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  47.37 
 
 		 320 aa  251  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  45.94 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  42.95 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  41.54 
 
 		 322 aa  250  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  46.43 
 
 		 308 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  46.36 
 
 		 312 aa  249  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>