237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1829 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  100 
 
 
320 aa  632  1e-180  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  96.87 
 
 
319 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  81.45 
 
 
318 aa  510  1e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  78.73 
 
 
320 aa  505  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  57.28 
 
 
320 aa  363  2e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  57.28 
 
 
325 aa  362  3e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  57.93 
 
 
317 aa  358  9e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  57.93 
 
 
334 aa  354  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  57.28 
 
 
317 aa  352  5e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  55.84 
 
 
322 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  55.84 
 
 
322 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  55.84 
 
 
322 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  55.84 
 
 
322 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  55.84 
 
 
337 aa  347  1e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  55.1 
 
 
325 aa  346  3e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  54.21 
 
 
321 aa  345  4e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  54.4 
 
 
317 aa  345  8e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  53.89 
 
 
321 aa  344  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  56.25 
 
 
321 aa  344  1e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  56.25 
 
 
321 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  56.25 
 
 
321 aa  343  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  56.25 
 
 
321 aa  343  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  56.25 
 
 
320 aa  343  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  56.25 
 
 
321 aa  343  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  55.92 
 
 
321 aa  342  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  55.74 
 
 
325 aa  341  8e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  55.62 
 
 
319 aa  339  4e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  56.17 
 
 
322 aa  338  7e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  57.93 
 
 
327 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  52.92 
 
 
325 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  57.61 
 
 
327 aa  335  9e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  50.32 
 
 
317 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  50.32 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
323 aa  320  1.9999999999999998e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  52.32 
 
 
316 aa  316  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  51.57 
 
 
315 aa  292  4e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  48.51 
 
 
328 aa  281  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  47.28 
 
 
318 aa  279  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  48.08 
 
 
329 aa  279  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  46.5 
 
 
331 aa  278  8e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  44.52 
 
 
320 aa  269  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  45.07 
 
 
337 aa  260  3e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  46.84 
 
 
328 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  46.18 
 
 
328 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  44.16 
 
 
321 aa  256  5e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  41.56 
 
 
330 aa  253  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
313 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  41.69 
 
 
306 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  43.31 
 
 
359 aa  249  5e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  41.35 
 
 
311 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  46.02 
 
 
328 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  42.53 
 
 
321 aa  248  7e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  47.52 
 
 
314 aa  248  8e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  44.25 
 
 
308 aa  248  1e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  42.72 
 
 
338 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  42.9 
 
 
314 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  42.9 
 
 
314 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  43.31 
 
 
318 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  45.21 
 
 
314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  44.13 
 
 
325 aa  245  6e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  44.19 
 
 
327 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  45.66 
 
 
313 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  44.15 
 
 
327 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  43.27 
 
 
327 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  38.78 
 
 
311 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  43.13 
 
 
312 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  43.75 
 
 
312 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  42.2 
 
 
330 aa  239  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  44.11 
 
 
318 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  40.07 
 
 
307 aa  239  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  41.56 
 
 
305 aa  238  9e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  43.84 
 
 
318 aa  238  1e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  39.94 
 
 
310 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  42.28 
 
 
327 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  42.21 
 
 
311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  46.18 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  43.89 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  42.21 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  43.15 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  43.22 
 
 
321 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  40.48 
 
 
354 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  41.49 
 
 
354 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  43.6 
 
 
352 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  39.38 
 
 
325 aa  229  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  40.56 
 
 
354 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  44.13 
 
 
344 aa  229  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
325 aa  228  7e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  43.79 
 
 
314 aa  229  7e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  42.72 
 
 
320 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
327 aa  228  8e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
327 aa  228  8e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  44.22 
 
 
308 aa  228  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  40.32 
 
 
354 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  39.08 
 
 
325 aa  227  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  42.43 
 
 
335 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
328 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
328 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  40.92 
 
 
330 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  43.73 
 
 
344 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
328 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>