247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0479 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  73.62 
 
 		 339 aa  462  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  73.36 
 
 		 343 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  55.59 
 
 		 314 aa  346  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  55.59 
 
 		 314 aa  346  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1566  integral membrane protein TerC  52.43 
 
 		 320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  47.77 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  44.76 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  41.9 
 
 		 329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  43.79 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  41.16 
 
 		 359 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  42.99 
 
 		 319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  42.68 
 
 		 320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  42.06 
 
 		 312 aa  242  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  44.7 
 
 		 320 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  44.41 
 
 		 318 aa  232  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  40.51 
 
 		 321 aa  232  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  39.62 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  41.61 
 
 		 314 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  41.12 
 
 		 313 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  39.43 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  42.19 
 
 		 314 aa  228  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  39.68 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  41.59 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  39.87 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  40.69 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  40.51 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  40.51 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  40.51 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  43.84 
 
 		 313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  40.14 
 
 		 307 aa  225  6e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  40.26 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  42.03 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  39.81 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  42.03 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  42.03 
 
 		 321 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  41.23 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  39.81 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  40.19 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  40.69 
 
 		 317 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  44.64 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  40.19 
 
 		 322 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  42.03 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  42.03 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  42.03 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  41.21 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  40.58 
 
 		 338 aa  222  6e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  39.61 
 
 		 318 aa  222  7e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  40.12 
 
 		 325 aa  222  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  41.69 
 
 		 321 aa  222  8e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  39.23 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  39.55 
 
 		 317 aa  220  3e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  38.29 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  42.11 
 
 		 344 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  39.81 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  41.12 
 
 		 344 aa  219  6e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  37.1 
 
 		 321 aa  219  7e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  39.38 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  42.9 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  39.87 
 
 		 315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  42.63 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  36.45 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  37.34 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  38.12 
 
 		 325 aa  215  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  41.67 
 
 		 337 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  41.42 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  37.67 
 
 		 310 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  36.16 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  37.12 
 
 		 330 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  36.71 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  38.41 
 
 		 319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  37.42 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  41.47 
 
 		 327 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  38.89 
 
 		 316 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  37.42 
 
 		 328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  37.66 
 
 		 327 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  35.56 
 
 		 322 aa  212  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  39.16 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  37.3 
 
 		 330 aa  212  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  40.88 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  41.46 
 
 		 330 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  37.66 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  39.53 
 
 		 318 aa  210  3e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  45.78 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  40.59 
 
 		 348 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  38.98 
 
 		 350 aa  208  9e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  40 
 
 		 387 aa  208  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  41.46 
 
 		 373 aa  207  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  37.18 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  39.94 
 
 		 337 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  38.65 
 
 		 318 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  36.72 
 
 		 347 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  38.15 
 
 		 352 aa  206  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  35.29 
 
 		 337 aa  204  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  39.48 
 
 		 342 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  35.97 
 
 		 332 aa  204  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  41.33 
 
 		 330 aa  205  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  36.96 
 
 		 346 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  39.29 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>