246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0083 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 344 aa  667    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  78.81 
 
 		 344 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  76.95 
 
 		 342 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  66.08 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  64.62 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  57.1 
 
 		 313 aa  317  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  52.85 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  50.78 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  52.38 
 
 		 322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  52.38 
 
 		 322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  52.38 
 
 		 322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  45 
 
 		 339 aa  309  5e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  55.45 
 
 		 334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  57.05 
 
 		 373 aa  300  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  50.49 
 
 		 322 aa  298  9e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  48.77 
 
 		 335 aa  297  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  48.09 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  50.49 
 
 		 320 aa  296  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  47.54 
 
 		 360 aa  295  6e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  49.15 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  46.08 
 
 		 321 aa  293  4e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  47.71 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  48.77 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  52.94 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  52.29 
 
 		 328 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  52.17 
 
 		 314 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  48.22 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  53.59 
 
 		 328 aa  271  8.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  44.05 
 
 		 354 aa  269  5e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  50.18 
 
 		 318 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  44.24 
 
 		 330 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  47.17 
 
 		 352 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  48.56 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  49.52 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  45.23 
 
 		 337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  48.08 
 
 		 317 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  47.57 
 
 		 329 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  47.76 
 
 		 321 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  48.73 
 
 		 320 aa  266  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  44.24 
 
 		 354 aa  265  8.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  47.48 
 
 		 359 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  43.11 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  47.28 
 
 		 317 aa  263  3e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  45.18 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  48.73 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  45.19 
 
 		 311 aa  262  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  45.98 
 
 		 316 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  44.05 
 
 		 354 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  44.68 
 
 		 354 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  43.94 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  42.39 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  49.21 
 
 		 325 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  48.42 
 
 		 322 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  48.42 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  41.14 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  48.42 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  47.08 
 
 		 330 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  47.44 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  48.42 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  45.54 
 
 		 347 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  49.52 
 
 		 325 aa  259  6e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  48.28 
 
 		 327 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  42.17 
 
 		 330 aa  258  9e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  43.87 
 
 		 333 aa  258  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  46.65 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  50.5 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  41.67 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  45.6 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  50.5 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  50.5 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  46.23 
 
 		 312 aa  256  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  50.5 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  50.5 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  50.5 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  50.5 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  47.28 
 
 		 328 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  46.28 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  47.28 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  46.86 
 
 		 346 aa  255  6e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  47.28 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  45.6 
 
 		 325 aa  255  8e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  50.5 
 
 		 321 aa  255  8e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  40.17 
 
 		 350 aa  255  9e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  50.99 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  44.04 
 
 		 307 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  50.17 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  46.96 
 
 		 328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  46.96 
 
 		 327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  46.96 
 
 		 327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  42.98 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  48.05 
 
 		 329 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  46.96 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  40.47 
 
 		 343 aa  253  3e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  44.28 
 
 		 348 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  46.96 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  46.25 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  46.47 
 
 		 320 aa  253  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>