229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3680 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 330 aa  649    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  66.35 
 
 		 330 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  62.31 
 
 		 329 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  61.49 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  64.12 
 
 		 327 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  61.34 
 
 		 327 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  62.99 
 
 		 327 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  60.44 
 
 		 354 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  58.86 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  58.86 
 
 		 327 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  59.51 
 
 		 325 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  58.79 
 
 		 325 aa  374  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  59.09 
 
 		 325 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  58.59 
 
 		 354 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  58.48 
 
 		 325 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  59.09 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  60.99 
 
 		 347 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  57.78 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  57.61 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  57.78 
 
 		 328 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  59.64 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  57.78 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  57.78 
 
 		 328 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  59.12 
 
 		 354 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  58.28 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  57.59 
 
 		 328 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  59.19 
 
 		 329 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  62.84 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  59.62 
 
 		 352 aa  358  8e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  55.62 
 
 		 329 aa  352  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  55.06 
 
 		 339 aa  352  7e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  55.14 
 
 		 344 aa  340  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  57.04 
 
 		 353 aa  340  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  58.07 
 
 		 324 aa  335  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  56.36 
 
 		 341 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  56.36 
 
 		 341 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  55.25 
 
 		 341 aa  331  1e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  57.19 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  48.73 
 
 		 338 aa  299  5e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  49.06 
 
 		 329 aa  296  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  52.6 
 
 		 314 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  46.81 
 
 		 320 aa  292  5e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  47.55 
 
 		 331 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  49.36 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  47.06 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  46.41 
 
 		 321 aa  288  9e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 328 aa  288  9e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  45.51 
 
 		 337 aa  288  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  45.28 
 
 		 317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  46.65 
 
 		 325 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  46.33 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  45.74 
 
 		 317 aa  279  5e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  48.24 
 
 		 313 aa  278  7e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  48.28 
 
 		 328 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  50.16 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  47.95 
 
 		 321 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  47.96 
 
 		 328 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  48.87 
 
 		 318 aa  276  3e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  49.53 
 
 		 325 aa  276  4e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  46.67 
 
 		 325 aa  276  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  47.15 
 
 		 312 aa  272  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  45.89 
 
 		 317 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  45.45 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  47.4 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  48.72 
 
 		 308 aa  271  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  47.66 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  47.08 
 
 		 321 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  47.08 
 
 		 321 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  47.08 
 
 		 321 aa  269  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  45.13 
 
 		 322 aa  268  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  47.08 
 
 		 320 aa  268  7e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  47.08 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  47.08 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  47.08 
 
 		 321 aa  268  8e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  45.13 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  45.13 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  45.13 
 
 		 337 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  46.75 
 
 		 321 aa  267  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  45.25 
 
 		 317 aa  267  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  43.85 
 
 		 306 aa  266  4e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  45.31 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  42.37 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  49.48 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  43.84 
 
 		 325 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  47.92 
 
 		 334 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  45.25 
 
 		 316 aa  261  8.999999999999999e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  43.18 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  45.6 
 
 		 324 aa  260  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  44.66 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  40.39 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  41.46 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  43.69 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  43.17 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  45.91 
 
 		 320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  40.19 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  46.58 
 
 		 344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  39.87 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  43.79 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  42.51 
 
 		 320 aa  249  7e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  43.57 
 
 		 319 aa  245  6.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>