232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4461 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  100 
 
 
334 aa  654    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  81.57 
 
 
327 aa  497  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  81.87 
 
 
327 aa  498  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  59.49 
 
 
325 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  60.82 
 
 
320 aa  384  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  57.73 
 
 
319 aa  377  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  57.93 
 
 
320 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  59.87 
 
 
318 aa  372  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  55.7 
 
 
325 aa  367  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  55.87 
 
 
320 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  53.82 
 
 
325 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  53.8 
 
 
317 aa  360  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  55.24 
 
 
323 aa  359  4e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  54.11 
 
 
322 aa  358  9e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  53.48 
 
 
317 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  54.11 
 
 
322 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  54.11 
 
 
322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  54.11 
 
 
322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  54.34 
 
 
317 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  53.94 
 
 
337 aa  355  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  52.62 
 
 
325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  52.65 
 
 
321 aa  352  4e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  52.65 
 
 
321 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  52.81 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  52.81 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  52.81 
 
 
320 aa  351  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  53.16 
 
 
321 aa  350  2e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  52.34 
 
 
321 aa  350  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  52.34 
 
 
321 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  53.16 
 
 
321 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  53.16 
 
 
322 aa  345  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  52.72 
 
 
317 aa  342  5e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  53.87 
 
 
316 aa  340  2e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  54.11 
 
 
319 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  52.72 
 
 
317 aa  329  4e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  51.08 
 
 
331 aa  305  7e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  48.79 
 
 
338 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  46.63 
 
 
328 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  46.52 
 
 
328 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  48.72 
 
 
328 aa  285  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  48.73 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  53.76 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  47.29 
 
 
359 aa  279  6e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  51.32 
 
 
314 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  48.62 
 
 
328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  46.29 
 
 
329 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  47.2 
 
 
330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  49.69 
 
 
325 aa  272  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  44.21 
 
 
337 aa  270  2e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  44.44 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  48.87 
 
 
313 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  44.62 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  44.62 
 
 
314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  44.34 
 
 
318 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  46.77 
 
 
318 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  43.22 
 
 
311 aa  265  1e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  46.44 
 
 
327 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  47.34 
 
 
334 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  43.19 
 
 
311 aa  256  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  45.26 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  45.96 
 
 
327 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  44.72 
 
 
320 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  44.98 
 
 
318 aa  251  1e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  42.37 
 
 
321 aa  251  1e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  45.1 
 
 
354 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  44.91 
 
 
354 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  44.65 
 
 
354 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  43.85 
 
 
321 aa  249  5e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  42.39 
 
 
354 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  41.82 
 
 
343 aa  248  8e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  45.03 
 
 
327 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  45.74 
 
 
312 aa  248  9e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  47.95 
 
 
308 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  43.2 
 
 
354 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  44.66 
 
 
311 aa  247  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  43.79 
 
 
320 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  42.11 
 
 
306 aa  246  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  42.17 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  44.41 
 
 
322 aa  245  6e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  42.36 
 
 
339 aa  245  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  44.83 
 
 
330 aa  245  8e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  45.54 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  43.48 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  45.26 
 
 
347 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
328 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  44.17 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  41.45 
 
 
310 aa  242  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  44.17 
 
 
328 aa  242  6e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  45.37 
 
 
346 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  43.38 
 
 
329 aa  242  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  45.48 
 
 
314 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  44.17 
 
 
328 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  44.97 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  44.34 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  48.2 
 
 
321 aa  239  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  43.87 
 
 
325 aa  238  8e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  41.45 
 
 
307 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 
325 aa  238  8e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>