215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1946 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 337 aa  676    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  61.14 
 
 		 338 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  58.05 
 
 		 359 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  49.35 
 
 		 327 aa  305  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  48.15 
 
 		 331 aa  298  6e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  46.67 
 
 		 329 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  49.52 
 
 		 329 aa  289  4e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  48.69 
 
 		 328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  45.63 
 
 		 327 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  47.06 
 
 		 320 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  46.2 
 
 		 325 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  45.95 
 
 		 330 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  44.01 
 
 		 327 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  46.13 
 
 		 325 aa  276  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  45.22 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  45.22 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  46.3 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  46.3 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  47.65 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  45.48 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  45.98 
 
 		 328 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  45.98 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  43.49 
 
 		 327 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  45.81 
 
 		 325 aa  275  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  45.13 
 
 		 354 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  45.98 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  45.73 
 
 		 330 aa  272  6e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  44.48 
 
 		 323 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  44.41 
 
 		 325 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  48.3 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  43.31 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  46.13 
 
 		 320 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  45.09 
 
 		 328 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  43.31 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  50.38 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  49.07 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  45.7 
 
 		 319 aa  260  2e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  45.07 
 
 		 320 aa  260  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  45.09 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  41.19 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  44.16 
 
 		 320 aa  259  4e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  44.09 
 
 		 316 aa  258  9e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  43.38 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  43.41 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  42.3 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  40.06 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  42.62 
 
 		 339 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  44.75 
 
 		 347 aa  256  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  44.21 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  40 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  39.7 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  44.93 
 
 		 346 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  46.49 
 
 		 322 aa  255  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  49.62 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  41.87 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  43.83 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  43.46 
 
 		 311 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  44.98 
 
 		 318 aa  253  3e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  46.64 
 
 		 322 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  50.57 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  41.9 
 
 		 318 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  46.64 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  40.7 
 
 		 354 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  43.01 
 
 		 352 aa  249  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  43.73 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  46.64 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  46.64 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  46.64 
 
 		 337 aa  249  6e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  51.31 
 
 		 313 aa  249  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  45.1 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  45.92 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  48.78 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  42.32 
 
 		 317 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  42.45 
 
 		 321 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  50.94 
 
 		 314 aa  245  9e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  44.95 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  41.59 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  44.95 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  45.58 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  45.58 
 
 		 320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  45.58 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  40.13 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  45.7 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  45.58 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  45.58 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  42.22 
 
 		 317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  45.58 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  43.54 
 
 		 305 aa  243  3.9999999999999997e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  50.38 
 
 		 314 aa  243  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  44.6 
 
 		 321 aa  242  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  45.65 
 
 		 313 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  41.99 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  45.37 
 
 		 327 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  48.31 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  41.77 
 
 		 353 aa  239  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  41.64 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  41.64 
 
 		 341 aa  238  8e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  43.9 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  46.64 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>