238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0880 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 341 aa  676    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  99.71 
 
 		 341 aa  675    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  94.71 
 
 		 353 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  77.02 
 
 		 344 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  70.09 
 
 		 341 aa  437  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  72.29 
 
 		 341 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  60.8 
 
 		 329 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  58.77 
 
 		 325 aa  375  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  58.54 
 
 		 354 aa  376  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  57.19 
 
 		 327 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  58.51 
 
 		 330 aa  361  8e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  57.01 
 
 		 329 aa  360  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  56.92 
 
 		 327 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  55.96 
 
 		 352 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  54.77 
 
 		 327 aa  350  2e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  53.82 
 
 		 339 aa  348  5e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  55.82 
 
 		 347 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  56.06 
 
 		 327 aa  344  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  56.71 
 
 		 346 aa  344  1e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  55.45 
 
 		 330 aa  334  1e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  54.35 
 
 		 328 aa  333  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  55.52 
 
 		 325 aa  330  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  55.21 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  56.88 
 
 		 334 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  55.52 
 
 		 327 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  55.52 
 
 		 327 aa  330  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  55.52 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  55.35 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  54.91 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  55.96 
 
 		 328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  55.21 
 
 		 325 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  55.32 
 
 		 329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  52.07 
 
 		 354 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  53.89 
 
 		 328 aa  325  9e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  54.13 
 
 		 354 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  52.66 
 
 		 354 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  52.89 
 
 		 354 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  53.09 
 
 		 324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  46.35 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  46.6 
 
 		 318 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  48.85 
 
 		 314 aa  265  5.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  45.85 
 
 		 328 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  45.23 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  44.59 
 
 		 359 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  44.89 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  44.98 
 
 		 328 aa  255  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  45.54 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  45.95 
 
 		 320 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  46.62 
 
 		 320 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  44.24 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  46.88 
 
 		 320 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  41.64 
 
 		 337 aa  245  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  44.44 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  40.91 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  42.32 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  43.47 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  45.73 
 
 		 325 aa  238  9e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  40.69 
 
 		 317 aa  238  9e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  43.41 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  43.41 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  44.66 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  43.4 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  45.31 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  42.22 
 
 		 322 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  43.11 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  43.11 
 
 		 321 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  42.12 
 
 		 325 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  42.22 
 
 		 337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  42.22 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  42.22 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  43.45 
 
 		 308 aa  235  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  44.34 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  44.34 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  44.34 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  41.01 
 
 		 317 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  44.34 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  41.46 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  41.92 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  44.34 
 
 		 344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  44.03 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  40.66 
 
 		 321 aa  232  5e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  44.05 
 
 		 323 aa  232  9e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  40.67 
 
 		 324 aa  229  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  41.9 
 
 		 321 aa  229  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  44.13 
 
 		 344 aa  229  7e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  44.44 
 
 		 342 aa  228  1e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  41.8 
 
 		 317 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  39.56 
 
 		 308 aa  227  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  39.34 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  42.15 
 
 		 317 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  41.01 
 
 		 316 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  41.79 
 
 		 339 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  43.71 
 
 		 322 aa  222  7e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  42.49 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  39.37 
 
 		 311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  44.59 
 
 		 360 aa  220  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  39.46 
 
 		 311 aa  220  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  42.19 
 
 		 312 aa  219  7e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  42.81 
 
 		 325 aa  219  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  39.38 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>