219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3199 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 329 aa  651    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  76.47 
 
 		 328 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  64.13 
 
 		 330 aa  401  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  59.38 
 
 		 327 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  58.26 
 
 		 329 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  57.32 
 
 		 327 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  58.44 
 
 		 325 aa  374  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  60.31 
 
 		 327 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  59.69 
 
 		 327 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  56.52 
 
 		 354 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  58.02 
 
 		 347 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  56 
 
 		 354 aa  353  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  58.62 
 
 		 346 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  55.96 
 
 		 354 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  55.56 
 
 		 354 aa  351  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  56.88 
 
 		 352 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  56.21 
 
 		 354 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  57.01 
 
 		 341 aa  346  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  57.01 
 
 		 341 aa  346  4e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  55.62 
 
 		 328 aa  342  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  56.13 
 
 		 325 aa  342  5e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  55.62 
 
 		 328 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  55.62 
 
 		 328 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  56.13 
 
 		 325 aa  341  9e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  56.13 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  56.13 
 
 		 327 aa  341  1e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  55.32 
 
 		 328 aa  341  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  56.52 
 
 		 353 aa  340  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  55.83 
 
 		 325 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  53.8 
 
 		 339 aa  339  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  55.62 
 
 		 330 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  55.28 
 
 		 344 aa  335  9e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  58.13 
 
 		 324 aa  332  4e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  54.41 
 
 		 328 aa  332  5e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  54.04 
 
 		 329 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  56.66 
 
 		 334 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  54.22 
 
 		 341 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  55.73 
 
 		 341 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  50 
 
 		 338 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  45.02 
 
 		 328 aa  278  7e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  49.83 
 
 		 314 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  45.37 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  43.08 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  41.32 
 
 		 328 aa  258  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  41.96 
 
 		 328 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  44.2 
 
 		 318 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  42.3 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  46.13 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  45.29 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  45.57 
 
 		 325 aa  252  6e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  41.59 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  40.88 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  41.78 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  43.93 
 
 		 325 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  42.06 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  44.52 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  40.88 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  42.27 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  42.11 
 
 		 321 aa  245  6.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  41.36 
 
 		 317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  41.08 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  41.51 
 
 		 321 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  43.34 
 
 		 320 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  43.59 
 
 		 308 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  40.69 
 
 		 316 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  43.69 
 
 		 320 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  43.65 
 
 		 313 aa  238  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  41.16 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  43 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  40.81 
 
 		 317 aa  235  7e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  39.81 
 
 		 317 aa  235  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  38.66 
 
 		 311 aa  233  3e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  40.67 
 
 		 321 aa  232  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  42.36 
 
 		 344 aa  232  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  39.63 
 
 		 322 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  39.63 
 
 		 322 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  39.63 
 
 		 322 aa  231  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  40.67 
 
 		 321 aa  231  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  41.56 
 
 		 335 aa  231  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  40.37 
 
 		 321 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  40.37 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  40.37 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  40.37 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  40.37 
 
 		 320 aa  230  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  40.37 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  40.78 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  39.88 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  40.06 
 
 		 321 aa  228  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  41.73 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  40.45 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  40.45 
 
 		 322 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  40.45 
 
 		 337 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  44.91 
 
 		 440 aa  226  4e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  37.38 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  40.45 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.46 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  42.26 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  43.3 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  43.8 
 
 		 318 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  40.12 
 
 		 322 aa  222  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>