237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1762 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  100 
 
 
319 aa  628  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  96.87 
 
 
320 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  81.76 
 
 
318 aa  513  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  79.31 
 
 
320 aa  510  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  57.59 
 
 
320 aa  365  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  57.59 
 
 
325 aa  364  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  58.58 
 
 
317 aa  361  8e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  58.9 
 
 
334 aa  358  6e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  57.93 
 
 
317 aa  355  6.999999999999999e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  56.82 
 
 
322 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  56.82 
 
 
322 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  56.82 
 
 
322 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  56.82 
 
 
322 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  56.82 
 
 
337 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  55.24 
 
 
325 aa  348  8e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  55.14 
 
 
321 aa  348  8e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  55.14 
 
 
321 aa  348  9e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  57.24 
 
 
321 aa  348  9e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  55.14 
 
 
321 aa  348  1e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  57.24 
 
 
321 aa  347  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  57.24 
 
 
321 aa  347  1e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  57.24 
 
 
320 aa  347  1e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  57.24 
 
 
321 aa  347  1e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  54.83 
 
 
321 aa  346  2e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  55.34 
 
 
317 aa  346  4e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  56.39 
 
 
325 aa  345  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  55.28 
 
 
322 aa  343  2e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  55.66 
 
 
319 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  58.2 
 
 
327 aa  340  2e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  58.25 
 
 
327 aa  338  7e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  51.4 
 
 
325 aa  338  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  50 
 
 
317 aa  322  5e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  50.48 
 
 
323 aa  322  6e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  52.09 
 
 
316 aa  319  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  50 
 
 
317 aa  318  6e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  50.5 
 
 
315 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  48.23 
 
 
328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  47.92 
 
 
318 aa  281  8.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  48.72 
 
 
329 aa  281  8.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  46.44 
 
 
331 aa  281  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  44.19 
 
 
320 aa  268  7e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  47.84 
 
 
328 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  45.7 
 
 
337 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  47.18 
 
 
328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  45.19 
 
 
313 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  42.5 
 
 
330 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
321 aa  257  1e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  44.27 
 
 
318 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  41.69 
 
 
306 aa  250  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  47.06 
 
 
328 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  42.86 
 
 
321 aa  250  3e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  44.06 
 
 
327 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  44.6 
 
 
308 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  43.22 
 
 
314 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  43.22 
 
 
314 aa  249  5e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  47.1 
 
 
314 aa  248  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  42.39 
 
 
338 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  41.86 
 
 
311 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  45.87 
 
 
314 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  44.44 
 
 
325 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  42.68 
 
 
359 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  44.52 
 
 
327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  45.48 
 
 
313 aa  243  5e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
327 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  39.87 
 
 
311 aa  242  7e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  39.75 
 
 
310 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  40.72 
 
 
307 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  44.44 
 
 
318 aa  241  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  43.48 
 
 
330 aa  241  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  43.59 
 
 
312 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  44.6 
 
 
318 aa  240  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  43.75 
 
 
312 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  42.9 
 
 
327 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  46.88 
 
 
334 aa  238  8e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  43.89 
 
 
321 aa  237  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  42.44 
 
 
311 aa  236  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  41.56 
 
 
305 aa  236  4e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  43.16 
 
 
329 aa  235  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
312 aa  235  9e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  43.15 
 
 
336 aa  235  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  42.01 
 
 
354 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  42.01 
 
 
354 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  43.14 
 
 
352 aa  232  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  40 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  40 
 
 
327 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  40 
 
 
327 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  40 
 
 
325 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  40.31 
 
 
328 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  40.31 
 
 
328 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  39.69 
 
 
325 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  41.27 
 
 
354 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  41.9 
 
 
320 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  40.31 
 
 
328 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  40.31 
 
 
328 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  44.55 
 
 
308 aa  230  3e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  44.21 
 
 
347 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  44.21 
 
 
346 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  44.14 
 
 
314 aa  229  4e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  40.63 
 
 
354 aa  229  6e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  40.85 
 
 
339 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>