239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A3485 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  99.69 
 
 
322 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  99.38 
 
 
337 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  100 
 
 
322 aa  640    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  99.38 
 
 
322 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  99.38 
 
 
322 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  89.31 
 
 
320 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  89.31 
 
 
321 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  89.31 
 
 
321 aa  580  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  89.31 
 
 
321 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  89.31 
 
 
321 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  88.99 
 
 
321 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  89.31 
 
 
321 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  89.31 
 
 
321 aa  580  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  89.31 
 
 
321 aa  579  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  88.82 
 
 
322 aa  569  1e-161  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  77.29 
 
 
317 aa  511  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  77.29 
 
 
317 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  78.23 
 
 
325 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  74.13 
 
 
317 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  74.53 
 
 
319 aa  479  1e-134  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  60.25 
 
 
320 aa  392  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  59.75 
 
 
325 aa  391  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  58.97 
 
 
316 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  56.55 
 
 
325 aa  372  1e-102  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  53.16 
 
 
325 aa  358  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  54.87 
 
 
323 aa  357  9.999999999999999e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  52.68 
 
 
317 aa  355  5e-97  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  56.82 
 
 
319 aa  353  2e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  58.12 
 
 
320 aa  353  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  55.84 
 
 
320 aa  349  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  52.68 
 
 
317 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  60.87 
 
 
315 aa  339  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  58.77 
 
 
318 aa  339  4e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  54.31 
 
 
334 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  53.25 
 
 
327 aa  312  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  53.25 
 
 
327 aa  311  9e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  49.69 
 
 
328 aa  302  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  51.44 
 
 
328 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  49.06 
 
 
328 aa  298  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
331 aa  298  8e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  46.18 
 
 
310 aa  293  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  46.47 
 
 
311 aa  293  3e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  52.56 
 
 
314 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  50.33 
 
 
320 aa  285  8e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  49.37 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  50.84 
 
 
329 aa  282  6.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  44.84 
 
 
311 aa  281  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  44.19 
 
 
306 aa  279  4e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  48.36 
 
 
338 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  45.98 
 
 
318 aa  277  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  43.73 
 
 
307 aa  276  3e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  50.17 
 
 
313 aa  275  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  46.98 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  49.83 
 
 
318 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  51.97 
 
 
313 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  45.97 
 
 
321 aa  268  8.999999999999999e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  45.65 
 
 
330 aa  268  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  49.15 
 
 
314 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  50.49 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  47.4 
 
 
308 aa  266  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  52.28 
 
 
334 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  46.03 
 
 
312 aa  265  7e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  46.18 
 
 
330 aa  264  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  48.12 
 
 
321 aa  264  2e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  46.29 
 
 
279 aa  263  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  46.84 
 
 
322 aa  263  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  49.45 
 
 
354 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  47.49 
 
 
352 aa  261  1e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  45.19 
 
 
311 aa  260  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  49.82 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  49.45 
 
 
359 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  49.82 
 
 
354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  45.4 
 
 
328 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  45.4 
 
 
328 aa  258  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  45.4 
 
 
328 aa  258  9e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  48.4 
 
 
312 aa  258  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  45.69 
 
 
327 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  43.16 
 
 
329 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  44.79 
 
 
328 aa  256  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  46.74 
 
 
354 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  43.87 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  44.06 
 
 
318 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 
325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  44.79 
 
 
328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  43.56 
 
 
325 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  46.64 
 
 
337 aa  251  8.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  43.08 
 
 
312 aa  251  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  42.68 
 
 
322 aa  251  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  43.19 
 
 
305 aa  251  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  42.54 
 
 
314 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  42.54 
 
 
314 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  48.73 
 
 
344 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  46.49 
 
 
314 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  45.11 
 
 
327 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  42.46 
 
 
325 aa  246  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  47.14 
 
 
347 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  42.41 
 
 
354 aa  245  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  47.14 
 
 
346 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>