253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1094 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  100 
 
 		 314 aa  624  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  58.63 
 
 		 343 aa  361  8e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  59.67 
 
 		 339 aa  361  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  55.59 
 
 		 318 aa  338  9e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1566  integral membrane protein TerC  57.69 
 
 		 320 aa  315  5e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  49.21 
 
 		 320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  44.65 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  44.37 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  42.86 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  42.86 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  42.86 
 
 		 337 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  42.54 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  42.54 
 
 		 322 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  43.22 
 
 		 319 aa  249  5e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  43.18 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  42.22 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  42.22 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  42.22 
 
 		 321 aa  246  2e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  42.22 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  42.22 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  42.9 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  42.22 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  42.22 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  42.22 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  41.9 
 
 		 321 aa  245  6.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  42.22 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  44.87 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  43.75 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  40 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  42.54 
 
 		 306 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  40.26 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  40.45 
 
 		 327 aa  238  9e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  40.76 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  40.84 
 
 		 350 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  42.24 
 
 		 314 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  40.56 
 
 		 321 aa  235  6e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  40.76 
 
 		 327 aa  235  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  39.37 
 
 		 317 aa  235  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  39.24 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  40.53 
 
 		 334 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  40.58 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  40.95 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  39.94 
 
 		 311 aa  232  5e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  39.68 
 
 		 310 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  43.32 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  40.13 
 
 		 319 aa  230  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  39.42 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  39.55 
 
 		 320 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  38.54 
 
 		 328 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  40.58 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  38.54 
 
 		 328 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  41.84 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  45.77 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  41.98 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  39.48 
 
 		 321 aa  228  9e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  39.69 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  39.37 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  38.19 
 
 		 316 aa  228  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  42.05 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  40.85 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  39.87 
 
 		 325 aa  226  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  43.09 
 
 		 360 aa  226  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  41.4 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  38.44 
 
 		 332 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  40.38 
 
 		 330 aa  226  6e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  37.85 
 
 		 311 aa  225  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  39.16 
 
 		 321 aa  225  9e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  39.59 
 
 		 320 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  42.19 
 
 		 323 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  38.98 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  40.07 
 
 		 313 aa  222  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  39.73 
 
 		 318 aa  222  6e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  41.38 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  41.38 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  42.62 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  38.61 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  38.74 
 
 		 344 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  41.28 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  38.34 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  41.61 
 
 		 314 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  40.2 
 
 		 322 aa  219  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  39.56 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  39.56 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  44.21 
 
 		 327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  39.56 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  40.88 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  44.21 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  40.88 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  41.19 
 
 		 325 aa  219  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  40.88 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  40.88 
 
 		 328 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  41.22 
 
 		 315 aa  219  7e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  40.88 
 
 		 325 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  40.88 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  37.87 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  39.88 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  37.87 
 
 		 344 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  38.31 
 
 		 335 aa  217  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  38.39 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>