240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1004 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
312 aa  623  1e-177  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  53.53 
 
 
331 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  55.1 
 
 
328 aa  322  5e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  51.33 
 
 
310 aa  316  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  51.31 
 
 
311 aa  312  4.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  51.13 
 
 
322 aa  311  9e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  54.18 
 
 
329 aa  311  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  51.19 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  50.5 
 
 
307 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  55.52 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  50.79 
 
 
320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  48.03 
 
 
311 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  46.73 
 
 
321 aa  289  4e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  48.01 
 
 
318 aa  287  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  45.42 
 
 
321 aa  286  4e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  47.51 
 
 
311 aa  285  5e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  48.26 
 
 
325 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  51.01 
 
 
308 aa  282  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  50.65 
 
 
373 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  49.03 
 
 
359 aa  280  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  49.67 
 
 
312 aa  280  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  50.17 
 
 
314 aa  278  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  48.1 
 
 
321 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  50 
 
 
318 aa  276  3e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  45.67 
 
 
308 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  49.2 
 
 
318 aa  275  8e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  47.65 
 
 
325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  51.53 
 
 
314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  51.88 
 
 
313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  49.04 
 
 
334 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  47.24 
 
 
305 aa  273  3e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  48.86 
 
 
320 aa  272  5.000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  44.79 
 
 
360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  48.4 
 
 
322 aa  267  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  47.15 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  50.53 
 
 
334 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  48.1 
 
 
328 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  48.1 
 
 
328 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  48.08 
 
 
322 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  48.08 
 
 
322 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  48.08 
 
 
322 aa  263  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  47.06 
 
 
312 aa  264  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  48.08 
 
 
337 aa  263  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  45.25 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  49.64 
 
 
314 aa  262  6e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  47.1 
 
 
317 aa  261  8.999999999999999e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  47.1 
 
 
325 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  47.34 
 
 
325 aa  260  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  44.04 
 
 
330 aa  260  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  45.92 
 
 
337 aa  259  4e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  46.13 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  44.09 
 
 
335 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  45.66 
 
 
338 aa  259  6e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  47.44 
 
 
322 aa  258  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  44.92 
 
 
317 aa  258  8e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  46.36 
 
 
330 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  51.47 
 
 
328 aa  256  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  45.03 
 
 
316 aa  256  4e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  43.77 
 
 
334 aa  255  6e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  45.34 
 
 
323 aa  255  8e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  44.9 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  44.9 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  44.9 
 
 
322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  44.92 
 
 
317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  48.97 
 
 
317 aa  253  4.0000000000000004e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  46.65 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  46.35 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  49.49 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  46.35 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  49.49 
 
 
321 aa  252  6e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  49.49 
 
 
321 aa  252  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  49.49 
 
 
320 aa  252  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  46.03 
 
 
321 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  46.03 
 
 
321 aa  251  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  45.14 
 
 
352 aa  250  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  45.3 
 
 
320 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  44.55 
 
 
319 aa  249  6e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  43.77 
 
 
320 aa  248  7e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
322 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  46.79 
 
 
342 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  43.26 
 
 
339 aa  247  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  43.46 
 
 
322 aa  246  3e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  46.01 
 
 
344 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  43.93 
 
 
327 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  46.01 
 
 
354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  46.32 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  43.75 
 
 
329 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  44.97 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  45.69 
 
 
354 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  44.33 
 
 
327 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  45.31 
 
 
319 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  45.28 
 
 
329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  43.31 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  48.51 
 
 
334 aa  242  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  44.29 
 
 
327 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  45.96 
 
 
320 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  42.77 
 
 
328 aa  242  7e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  43.09 
 
 
354 aa  241  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  44.26 
 
 
318 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  43.33 
 
 
327 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>