243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2543 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  98.46 
 
 		 325 aa  641    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  98.15 
 
 		 325 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 327 aa  652    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 327 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  99.69 
 
 		 325 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  95.41 
 
 		 328 aa  629  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  95.11 
 
 		 328 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  95.11 
 
 		 328 aa  628  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  94.5 
 
 		 328 aa  624  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  92.05 
 
 		 328 aa  607  1e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  66.67 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  64.4 
 
 		 327 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  64.67 
 
 		 327 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  65.12 
 
 		 327 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  60.99 
 
 		 325 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  57.06 
 
 		 327 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  65.14 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  58.86 
 
 		 330 aa  360  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  61.23 
 
 		 347 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  60.12 
 
 		 354 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  60.8 
 
 		 346 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  57.98 
 
 		 329 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  57.49 
 
 		 328 aa  354  1e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  59.82 
 
 		 354 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  55.8 
 
 		 339 aa  349  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  59.63 
 
 		 354 aa  349  5e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  59.15 
 
 		 354 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  54.89 
 
 		 354 aa  346  4e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  54.74 
 
 		 344 aa  343  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  56.13 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  58.46 
 
 		 352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  57.45 
 
 		 329 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  62.31 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  55.32 
 
 		 341 aa  323  3e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  54.91 
 
 		 353 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  55.83 
 
 		 341 aa  318  6e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  55.52 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  55.02 
 
 		 341 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  48.92 
 
 		 331 aa  285  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  48.73 
 
 		 329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  47.27 
 
 		 328 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  49.35 
 
 		 314 aa  278  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  45.22 
 
 		 337 aa  277  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  46.11 
 
 		 320 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  48.43 
 
 		 328 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  48.73 
 
 		 338 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  47.8 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  47.92 
 
 		 359 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  45.73 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  47.83 
 
 		 323 aa  265  7e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  44.69 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  44.79 
 
 		 317 aa  261  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  43.38 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  45.09 
 
 		 317 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  45 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  46.85 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  46.88 
 
 		 318 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  46.15 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  45.06 
 
 		 317 aa  256  3e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  49.64 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  45.87 
 
 		 321 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  45.57 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  45.57 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  43.87 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  45.57 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  45.57 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  46.03 
 
 		 313 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  45.57 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  45.57 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  45.57 
 
 		 321 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  43.87 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  45.26 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  43.87 
 
 		 322 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  43.87 
 
 		 322 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  43.87 
 
 		 337 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  43.04 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  46.2 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  45.54 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  44.2 
 
 		 316 aa  249  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  42.39 
 
 		 321 aa  248  8e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  44.58 
 
 		 324 aa  248  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  44.19 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  42.71 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  44.27 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  46.96 
 
 		 344 aa  242  6e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  44.72 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  45.4 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  42.05 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  44.79 
 
 		 322 aa  240  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  44.79 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  41.97 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  42.99 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  43.17 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  40.95 
 
 		 311 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  45.52 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  44.98 
 
 		 344 aa  235  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  42.47 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  40 
 
 		 319 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  41.85 
 
 		 305 aa  232  7.000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  44.73 
 
 		 342 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>