219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3568 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 312 aa  614  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  71.43 
 
 		 314 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  69.13 
 
 		 314 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  67.11 
 
 		 313 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  64.82 
 
 		 312 aa  394  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  59.61 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  59.67 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  59.42 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  57 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  57 
 
 		 307 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  55.3 
 
 		 328 aa  326  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  53.72 
 
 		 329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  50.32 
 
 		 331 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  47.87 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  48.85 
 
 		 321 aa  296  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  48.05 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  47.78 
 
 		 308 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  47.71 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  51.28 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  50.17 
 
 		 328 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  49.19 
 
 		 318 aa  275  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  49.83 
 
 		 328 aa  275  9e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  47.08 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  51.37 
 
 		 314 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  49.32 
 
 		 359 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  52.61 
 
 		 328 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  49.35 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  48.56 
 
 		 323 aa  270  2.9999999999999997e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  44.48 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  47.1 
 
 		 325 aa  267  1e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  50.93 
 
 		 338 aa  266  4e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  47.44 
 
 		 320 aa  265  5e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  52.38 
 
 		 313 aa  265  5.999999999999999e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  44.24 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  48.53 
 
 		 308 aa  264  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  44.24 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  44.24 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  47.32 
 
 		 322 aa  263  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  46.45 
 
 		 317 aa  263  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  45.91 
 
 		 318 aa  262  6.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  44.52 
 
 		 317 aa  258  7e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  52.26 
 
 		 334 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  48.8 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  47.91 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  46.2 
 
 		 325 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  48.59 
 
 		 320 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  46.45 
 
 		 317 aa  255  7e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  47.06 
 
 		 312 aa  255  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  48.24 
 
 		 320 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  47.89 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  45.02 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  43.08 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  43.08 
 
 		 322 aa  252  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  43.08 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  43.08 
 
 		 322 aa  252  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  43.08 
 
 		 322 aa  251  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  45.05 
 
 		 325 aa  251  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  45.16 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  45.22 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  45.92 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  45.92 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  45.92 
 
 		 321 aa  250  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  45.92 
 
 		 321 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  45.92 
 
 		 321 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  45.92 
 
 		 320 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  45.92 
 
 		 321 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  45.92 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  45.92 
 
 		 321 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  43.13 
 
 		 317 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  44.71 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  43.45 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  42.41 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4581  Integral membrane protein TerC  41.76 
 
 		 357 aa  242  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1943  Integral membrane protein TerC  46.05 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  42.95 
 
 		 360 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  48.31 
 
 		 337 aa  239  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  43 
 
 		 322 aa  239  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  43 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  42.45 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  44.95 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5754  Integral membrane protein TerC  41.43 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 		 319 aa  235  8e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  42.68 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  42.21 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  41.28 
 
 		 344 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  45.2 
 
 		 344 aa  233  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  44.88 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  44.95 
 
 		 318 aa  229  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  44.22 
 
 		 342 aa  228  7e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2152  integral membrane protein TerC  40.31 
 
 		 405 aa  228  9e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.305703  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  42.14 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  43.01 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  41.5 
 
 		 330 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  41.67 
 
 		 354 aa  226  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  42.35 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  39.55 
 
 		 339 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  41.28 
 
 		 332 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  40.66 
 
 		 330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  40.59 
 
 		 318 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  44.8 
 
 		 346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>