247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3448 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
360 aa  701    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  68.6 
 
 
339 aa  467  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  56.6 
 
 
334 aa  344  1e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  56.23 
 
 
373 aa  322  5e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  48.92 
 
 
325 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  48.25 
 
 
322 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  48.25 
 
 
322 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  48.25 
 
 
322 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
328 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  47.34 
 
 
334 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  50 
 
 
329 aa  299  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  46.6 
 
 
320 aa  292  6e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  45.1 
 
 
321 aa  290  2e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  44.77 
 
 
321 aa  290  3e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  46.82 
 
 
331 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  45 
 
 
308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  47.54 
 
 
344 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  43.3 
 
 
334 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  45.54 
 
 
335 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  45.93 
 
 
342 aa  276  4e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  45.1 
 
 
311 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  42.9 
 
 
399 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  46.08 
 
 
313 aa  270  2e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  46 
 
 
306 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  46.33 
 
 
314 aa  270  4e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  46.03 
 
 
305 aa  270  4e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  44.26 
 
 
322 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  42.9 
 
 
311 aa  267  2e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  46.67 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  44.03 
 
 
322 aa  266  5.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  46.23 
 
 
344 aa  263  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  45.67 
 
 
307 aa  263  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  45.1 
 
 
311 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  44.94 
 
 
321 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  44.26 
 
 
308 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  42.94 
 
 
322 aa  260  3e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  46.71 
 
 
337 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  43.14 
 
 
310 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  42.96 
 
 
318 aa  257  3e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  44.94 
 
 
312 aa  256  4e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  44.76 
 
 
334 aa  256  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  43.58 
 
 
338 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  41.07 
 
 
337 aa  252  7e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  43.16 
 
 
330 aa  251  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  43.35 
 
 
330 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  44.73 
 
 
324 aa  249  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  43.34 
 
 
328 aa  248  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  43.04 
 
 
318 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  44.06 
 
 
314 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  42.72 
 
 
327 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  43.48 
 
 
328 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  39.71 
 
 
350 aa  247  2e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  45.12 
 
 
327 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  43.4 
 
 
333 aa  247  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  40.18 
 
 
343 aa  247  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  40.27 
 
 
387 aa  246  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  42.72 
 
 
312 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  44.05 
 
 
330 aa  246  6e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  41.77 
 
 
352 aa  246  6e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  41.42 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  43.77 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  41.19 
 
 
333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  43.65 
 
 
314 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  42.14 
 
 
330 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  41.33 
 
 
346 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  42.9 
 
 
330 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  43.63 
 
 
400 aa  243  5e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  41.16 
 
 
346 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  41.16 
 
 
346 aa  242  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  42.95 
 
 
312 aa  240  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  41.61 
 
 
317 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  41.72 
 
 
320 aa  238  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  44.05 
 
 
317 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  42.31 
 
 
318 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  47.69 
 
 
337 aa  237  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  44.66 
 
 
328 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  38.98 
 
 
359 aa  236  4e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1943  Integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
332 aa  236  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153344 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  44.48 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  41.84 
 
 
320 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  44.48 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  38.92 
 
 
398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  42.62 
 
 
328 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  40.12 
 
 
342 aa  235  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  44.48 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  43.41 
 
 
317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  42.36 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  42.36 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  41.96 
 
 
341 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  42.36 
 
 
399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  41.84 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  39.22 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  44.48 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  44.48 
 
 
337 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
327 aa  233  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  40.12 
 
 
343 aa  233  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  37.01 
 
 
354 aa  232  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
332 aa  232  6e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  40.92 
 
 
332 aa  232  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>