229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3019 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
343 aa  687    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  72.92 
 
 
337 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  52.38 
 
 
330 aa  357  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  54.82 
 
 
330 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  51.75 
 
 
333 aa  349  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  51.8 
 
 
332 aa  345  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  52.41 
 
 
330 aa  337  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  51.6 
 
 
336 aa  334  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  53.31 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  49.71 
 
 
387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  48.84 
 
 
399 aa  325  5e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  52.1 
 
 
329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  51.04 
 
 
332 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  49.85 
 
 
352 aa  316  3e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  50.76 
 
 
333 aa  315  7e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  47.9 
 
 
350 aa  314  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  50.15 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  49.28 
 
 
367 aa  311  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  48.04 
 
 
400 aa  305  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  47.18 
 
 
360 aa  305  7e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  48.65 
 
 
398 aa  301  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  46.13 
 
 
342 aa  300  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  46.9 
 
 
352 aa  300  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  48.94 
 
 
369 aa  298  7e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  50.3 
 
 
399 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  50.3 
 
 
399 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  50.3 
 
 
399 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  49 
 
 
341 aa  296  5e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  48.99 
 
 
346 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  48.99 
 
 
346 aa  295  7e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  44.78 
 
 
328 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  47.31 
 
 
330 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  48.29 
 
 
346 aa  293  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  48.4 
 
 
338 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  45.58 
 
 
362 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  48.49 
 
 
334 aa  289  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  47.16 
 
 
348 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  47.83 
 
 
348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  48.24 
 
 
342 aa  282  7.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  48.65 
 
 
399 aa  281  1e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  48.36 
 
 
419 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  44.95 
 
 
328 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  43.56 
 
 
337 aa  272  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  51.56 
 
 
337 aa  265  5.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  44.91 
 
 
328 aa  265  8.999999999999999e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  51.29 
 
 
474 aa  259  3e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  51.9 
 
 
337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  40.41 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  42.73 
 
 
397 aa  252  6e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  44.84 
 
 
337 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  40.18 
 
 
360 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  41.03 
 
 
322 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  41.03 
 
 
322 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  41.03 
 
 
322 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  39.64 
 
 
325 aa  245  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  40.47 
 
 
344 aa  245  9e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  45.49 
 
 
346 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  39.07 
 
 
334 aa  242  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  39.45 
 
 
339 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  40.99 
 
 
329 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  41.95 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  38.6 
 
 
335 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  43.04 
 
 
308 aa  238  9e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  39.88 
 
 
331 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  40.45 
 
 
308 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  39.43 
 
 
334 aa  235  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  39.77 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  39.16 
 
 
321 aa  233  5e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  38.71 
 
 
322 aa  232  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  38.66 
 
 
342 aa  231  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  46.9 
 
 
346 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  39.81 
 
 
321 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  39.24 
 
 
346 aa  229  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  37.97 
 
 
354 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  41.53 
 
 
338 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  37.14 
 
 
354 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  38.78 
 
 
347 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  38.51 
 
 
322 aa  225  8e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  40.29 
 
 
330 aa  224  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  36.73 
 
 
354 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  39.26 
 
 
313 aa  223  4e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  43.03 
 
 
373 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  38.24 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  37.2 
 
 
319 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  38.03 
 
 
354 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  39.7 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  38.6 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  37.54 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  39.74 
 
 
339 aa  220  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  39.1 
 
 
320 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  39.51 
 
 
311 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  40.97 
 
 
359 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  38.99 
 
 
329 aa  216  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  43.91 
 
 
346 aa  216  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  39.27 
 
 
343 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  38.46 
 
 
325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  36.83 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  37.27 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  36.79 
 
 
307 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  37.96 
 
 
321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>