222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3363 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  100 
 
 
332 aa  653    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  95.17 
 
 
332 aa  608  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  63.95 
 
 
399 aa  422  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  60.67 
 
 
352 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  63.9 
 
 
328 aa  402  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  65.4 
 
 
369 aa  402  1e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  62.3 
 
 
328 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  59.02 
 
 
330 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  57.58 
 
 
332 aa  385  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  61.8 
 
 
330 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  57.57 
 
 
362 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  61.47 
 
 
341 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  60.39 
 
 
328 aa  375  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  56.44 
 
 
387 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  58.04 
 
 
346 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  58.04 
 
 
346 aa  364  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  58.01 
 
 
346 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  59.63 
 
 
348 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  58.54 
 
 
352 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  59.8 
 
 
342 aa  362  6e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  56.44 
 
 
333 aa  360  1e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  55.93 
 
 
398 aa  355  5.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  53.31 
 
 
333 aa  355  6.999999999999999e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  55.39 
 
 
350 aa  352  7e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  54.66 
 
 
330 aa  351  1e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  54.71 
 
 
400 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  57.53 
 
 
324 aa  346  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  54.97 
 
 
336 aa  345  5e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  52.74 
 
 
342 aa  345  5e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  55.62 
 
 
329 aa  345  8.999999999999999e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  53.8 
 
 
330 aa  344  1e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  54.1 
 
 
360 aa  342  7e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  54.08 
 
 
399 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  54.79 
 
 
367 aa  335  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  52.28 
 
 
399 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  52.28 
 
 
399 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  52.28 
 
 
399 aa  332  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  50.15 
 
 
343 aa  328  9e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  49.12 
 
 
337 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  55.97 
 
 
419 aa  314  9.999999999999999e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  48.2 
 
 
397 aa  308  8e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  52.98 
 
 
348 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  51.14 
 
 
474 aa  299  5e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  50.77 
 
 
338 aa  291  8e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  50.31 
 
 
334 aa  282  6.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  50.62 
 
 
337 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  42.68 
 
 
328 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  53.05 
 
 
346 aa  261  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  51.69 
 
 
337 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  45.17 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  46.91 
 
 
337 aa  250  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  43.65 
 
 
331 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  43.17 
 
 
337 aa  246  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11220  tellurium resistance membrane protein TerC  56.36 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  38.27 
 
 
306 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  41.69 
 
 
320 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  39.5 
 
 
321 aa  239  5e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  41.43 
 
 
339 aa  238  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  41.59 
 
 
329 aa  237  2e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  42.17 
 
 
344 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  42.06 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  41.77 
 
 
360 aa  235  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  39.54 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  38.24 
 
 
321 aa  233  3e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  44.37 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  36.92 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  42.59 
 
 
312 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
322 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
322 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
322 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  40.84 
 
 
335 aa  228  8e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  45.66 
 
 
334 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  39.81 
 
 
312 aa  226  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  45.19 
 
 
359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  47.41 
 
 
346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  41.3 
 
 
334 aa  226  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  35.89 
 
 
311 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  43.39 
 
 
313 aa  224  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  39.88 
 
 
325 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.35 
 
 
325 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  41.38 
 
 
314 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  39.34 
 
 
318 aa  223  4e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  35.08 
 
 
310 aa  223  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  38.48 
 
 
320 aa  223  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  38.3 
 
 
319 aa  222  4.9999999999999996e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  40.98 
 
 
344 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  44.57 
 
 
320 aa  222  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  43.62 
 
 
322 aa  222  7e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  43.57 
 
 
373 aa  222  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  38.7 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  40.41 
 
 
308 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  40.87 
 
 
318 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  40.65 
 
 
323 aa  219  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  42.39 
 
 
338 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  36.53 
 
 
305 aa  217  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  39.8 
 
 
318 aa  217  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  39.08 
 
 
314 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  40.79 
 
 
314 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  40.79 
 
 
314 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  38.23 
 
 
286 aa  216  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>