219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5513 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
330 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  62.92 
 
 
336 aa  402  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  64.33 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  60.5 
 
 
399 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  62.65 
 
 
369 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  59.2 
 
 
332 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  61.8 
 
 
332 aa  375  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  61.8 
 
 
332 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  56.71 
 
 
333 aa  366  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  54.1 
 
 
337 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  59.26 
 
 
329 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  57.23 
 
 
328 aa  362  7.0000000000000005e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  58.7 
 
 
387 aa  357  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  52.38 
 
 
343 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  57.96 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  59.19 
 
 
333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  55.83 
 
 
352 aa  355  3.9999999999999996e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  57.19 
 
 
330 aa  354  1e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  57.99 
 
 
328 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  60.92 
 
 
324 aa  350  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  58.13 
 
 
350 aa  349  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  56.01 
 
 
352 aa  348  5e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  56.66 
 
 
328 aa  347  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  54.98 
 
 
342 aa  344  1e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  56.07 
 
 
330 aa  343  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  56.55 
 
 
341 aa  334  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  55.73 
 
 
348 aa  333  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  57.05 
 
 
400 aa  332  8e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  55.03 
 
 
398 aa  331  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  53.64 
 
 
362 aa  329  4e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  55.62 
 
 
346 aa  328  6e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  56.56 
 
 
346 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  56.56 
 
 
346 aa  328  7e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  54.86 
 
 
360 aa  325  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  54.69 
 
 
334 aa  316  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  52.83 
 
 
399 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  52.83 
 
 
399 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  52.83 
 
 
399 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  55.03 
 
 
399 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  55.8 
 
 
342 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  54.69 
 
 
338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  53.73 
 
 
348 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  55.94 
 
 
337 aa  300  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  55.62 
 
 
337 aa  285  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  51.58 
 
 
397 aa  285  8e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  52.22 
 
 
419 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  45.15 
 
 
328 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  54.85 
 
 
337 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  43.83 
 
 
331 aa  271  1e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  50.81 
 
 
474 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  44.62 
 
 
322 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  44.62 
 
 
322 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  44.62 
 
 
322 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  45.4 
 
 
329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  52.16 
 
 
346 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  43.84 
 
 
320 aa  264  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  44.24 
 
 
344 aa  263  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  48.71 
 
 
334 aa  263  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  43.26 
 
 
325 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  45.26 
 
 
337 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  42.36 
 
 
306 aa  256  3e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  47 
 
 
322 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  41.27 
 
 
339 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  43.71 
 
 
344 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  43.71 
 
 
335 aa  252  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  44.03 
 
 
334 aa  252  7e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  43.35 
 
 
360 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  43.43 
 
 
321 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  44.04 
 
 
312 aa  250  2e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  42.59 
 
 
307 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  40.18 
 
 
311 aa  248  7e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  42.68 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  39.88 
 
 
311 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  44.1 
 
 
313 aa  243  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  42.11 
 
 
321 aa  242  7e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  42.77 
 
 
318 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  42.64 
 
 
313 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  39.81 
 
 
310 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  44.3 
 
 
312 aa  239  5e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  43.22 
 
 
308 aa  237  2e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  45.42 
 
 
308 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  47.99 
 
 
346 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  39.25 
 
 
321 aa  235  7e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  40.58 
 
 
322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  43.31 
 
 
342 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  45.79 
 
 
314 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  44.13 
 
 
314 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  46.18 
 
 
373 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  43.87 
 
 
311 aa  230  3e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  38.84 
 
 
327 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  38.84 
 
 
327 aa  230  3e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  38.84 
 
 
325 aa  230  3e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  41.56 
 
 
320 aa  228  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  38.84 
 
 
325 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  39.51 
 
 
328 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  39.51 
 
 
328 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  39.51 
 
 
328 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  38.84 
 
 
325 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  45.32 
 
 
314 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  47.1 
 
 
359 aa  227  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>