230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2071 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  100 
 
 
362 aa  722    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  90.64 
 
 
342 aa  579  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  61.4 
 
 
369 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  60.67 
 
 
328 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  58.88 
 
 
328 aa  392  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  55.69 
 
 
399 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  59.24 
 
 
332 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  60.4 
 
 
332 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  57.81 
 
 
352 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  58.05 
 
 
332 aa  376  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  56.88 
 
 
346 aa  362  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  54.91 
 
 
328 aa  362  4e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  56.88 
 
 
346 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  56.88 
 
 
346 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  50.92 
 
 
387 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  53.64 
 
 
330 aa  348  1e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  55.56 
 
 
341 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  52.8 
 
 
350 aa  347  2e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  52.49 
 
 
342 aa  346  4e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  54.46 
 
 
348 aa  346  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  52.25 
 
 
330 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  56.38 
 
 
330 aa  342  7e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  53.92 
 
 
333 aa  340  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  52.68 
 
 
352 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  51.2 
 
 
333 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  50.59 
 
 
330 aa  329  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  51.94 
 
 
360 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  52.37 
 
 
400 aa  325  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  49.42 
 
 
367 aa  323  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  52.19 
 
 
398 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  51.83 
 
 
329 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  52.72 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11220  tellurium resistance membrane protein TerC  67.12 
 
 
310 aa  304  2.0000000000000002e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  52.6 
 
 
474 aa  303  3.0000000000000004e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  46.72 
 
 
343 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  47.49 
 
 
337 aa  301  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  51.09 
 
 
324 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  53 
 
 
419 aa  291  8e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  48.9 
 
 
399 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  48.9 
 
 
399 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  48.9 
 
 
399 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  46.89 
 
 
336 aa  288  1e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  45.53 
 
 
348 aa  286  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  49.35 
 
 
338 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  46.95 
 
 
334 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  46.87 
 
 
346 aa  256  6e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  41.64 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  43.17 
 
 
339 aa  252  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  41.54 
 
 
397 aa  251  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  48.56 
 
 
337 aa  250  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  41.99 
 
 
321 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  46.45 
 
 
337 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  41.27 
 
 
328 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  40.33 
 
 
321 aa  237  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  43.09 
 
 
337 aa  237  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  46.39 
 
 
337 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  39.8 
 
 
308 aa  235  9e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  43.24 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  41.77 
 
 
360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
322 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
322 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
322 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  38.91 
 
 
320 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  40.18 
 
 
322 aa  229  6e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  39.58 
 
 
314 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  43.29 
 
 
334 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  39.58 
 
 
314 aa  226  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  43.41 
 
 
313 aa  225  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  39.43 
 
 
325 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  40.57 
 
 
359 aa  223  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  39.81 
 
 
344 aa  222  9e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  38.7 
 
 
308 aa  222  9e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  37.77 
 
 
329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  42.95 
 
 
339 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
313 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  42.41 
 
 
314 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  37.54 
 
 
306 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  37.62 
 
 
307 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  38.74 
 
 
335 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  37.89 
 
 
322 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  38.91 
 
 
318 aa  217  2e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  41.73 
 
 
334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  41.44 
 
 
312 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  42.05 
 
 
343 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  42.9 
 
 
314 aa  216  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  37.04 
 
 
334 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  40.13 
 
 
344 aa  215  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  37.3 
 
 
354 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  36.79 
 
 
311 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  36.88 
 
 
320 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  36.13 
 
 
347 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  40.74 
 
 
334 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  35.87 
 
 
310 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  37.85 
 
 
318 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  40.6 
 
 
314 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  43.09 
 
 
312 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  37.76 
 
 
312 aa  208  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  36.74 
 
 
354 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  37.76 
 
 
324 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  35.37 
 
 
319 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>