217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  100 
 
 
333 aa  661    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  75.38 
 
 
333 aa  510  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  76.9 
 
 
352 aa  498  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  71.43 
 
 
330 aa  481  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  71.17 
 
 
387 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  64.51 
 
 
330 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  58.91 
 
 
332 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  57.1 
 
 
350 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  56.55 
 
 
400 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  57.1 
 
 
398 aa  368  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  56.71 
 
 
330 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  58.41 
 
 
399 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  58.41 
 
 
399 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  58.41 
 
 
399 aa  360  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  55.52 
 
 
399 aa  358  9e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  57.76 
 
 
360 aa  358  9e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  56.44 
 
 
332 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  56.17 
 
 
332 aa  354  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  54.35 
 
 
399 aa  351  8e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  56.75 
 
 
329 aa  349  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  51.75 
 
 
343 aa  349  4e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  57.33 
 
 
419 aa  345  7e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  53.25 
 
 
328 aa  341  9e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  51.5 
 
 
337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  53.25 
 
 
342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  53.43 
 
 
336 aa  333  2e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  51.82 
 
 
330 aa  333  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  52.73 
 
 
352 aa  331  9e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  54.18 
 
 
369 aa  331  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  52.31 
 
 
397 aa  330  3e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  53.5 
 
 
346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  53.5 
 
 
346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  53.5 
 
 
346 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  50.9 
 
 
362 aa  323  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  51.95 
 
 
341 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  51.8 
 
 
348 aa  322  6e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  52.92 
 
 
328 aa  322  8e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  53.73 
 
 
367 aa  320  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  51.39 
 
 
342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  56.33 
 
 
474 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  49.38 
 
 
328 aa  309  4e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  53.96 
 
 
324 aa  309  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  50.45 
 
 
334 aa  299  4e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  51.06 
 
 
348 aa  295  6e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  49.69 
 
 
338 aa  280  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  50.15 
 
 
337 aa  271  8.000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  52.65 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  44.86 
 
 
325 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  49.55 
 
 
337 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  44.06 
 
 
322 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  44.06 
 
 
322 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  44.06 
 
 
322 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  44 
 
 
337 aa  255  8e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  43.87 
 
 
344 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  42.6 
 
 
334 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  42.42 
 
 
339 aa  250  3e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  42.6 
 
 
335 aa  249  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  43.16 
 
 
322 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  41.25 
 
 
328 aa  245  6e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  41.19 
 
 
360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  44.41 
 
 
313 aa  242  6e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  45.85 
 
 
334 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  48.93 
 
 
346 aa  241  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  46.48 
 
 
346 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  43.25 
 
 
344 aa  233  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  39.31 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  43.29 
 
 
334 aa  231  2e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  39.47 
 
 
320 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  39.14 
 
 
331 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  45.45 
 
 
373 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  42.33 
 
 
342 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  38.05 
 
 
321 aa  226  4e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  41.64 
 
 
308 aa  225  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  39.48 
 
 
308 aa  225  9e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  40.19 
 
 
320 aa  224  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  46.41 
 
 
346 aa  224  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  39.81 
 
 
311 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  39.68 
 
 
313 aa  223  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  39.69 
 
 
329 aa  222  6e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  37.87 
 
 
325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  38.18 
 
 
315 aa  220  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  39.08 
 
 
321 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  38.15 
 
 
328 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  38.15 
 
 
328 aa  217  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  36.48 
 
 
306 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  39.62 
 
 
314 aa  215  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  37.89 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  42.26 
 
 
328 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  37.89 
 
 
312 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  38.44 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  40.51 
 
 
314 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  37.91 
 
 
325 aa  212  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  39.06 
 
 
320 aa  212  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  39.06 
 
 
318 aa  210  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  36.7 
 
 
322 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  39.42 
 
 
339 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  50 
 
 
440 aa  209  6e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4839  Integral membrane protein TerC  41.38 
 
 
316 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  36.62 
 
 
322 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  35.85 
 
 
307 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>