229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1962 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 369 aa  729    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  63.72 
 
 		 328 aa  410  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  57.45 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  55.07 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  64.98 
 
 		 328 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  65.4 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  64.76 
 
 		 332 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  64.8 
 
 		 342 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  57.67 
 
 		 328 aa  396  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  62.65 
 
 		 330 aa  390  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  58.46 
 
 		 352 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  62.35 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  62.35 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  62.35 
 
 		 346 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  63.91 
 
 		 341 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  51.31 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  56.93 
 
 		 342 aa  363  2e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  60.19 
 
 		 348 aa  363  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  58.23 
 
 		 330 aa  358  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  53.73 
 
 		 330 aa  350  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  55.06 
 
 		 352 aa  347  1e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  54.18 
 
 		 333 aa  343  2e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  54.43 
 
 		 330 aa  343  2.9999999999999997e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  57.09 
 
 		 332 aa  342  7e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  50.95 
 
 		 400 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  52.87 
 
 		 333 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  53.06 
 
 		 367 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  54.13 
 
 		 350 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  56.35 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  53.58 
 
 		 398 aa  332  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  51.45 
 
 		 336 aa  331  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  56.52 
 
 		 324 aa  326  5e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  51.1 
 
 		 399 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  50.29 
 
 		 360 aa  324  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  48.2 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  48.2 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  48.2 
 
 		 399 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  51.04 
 
 		 348 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  47.13 
 
 		 337 aa  311  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  47.18 
 
 		 343 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  53.65 
 
 		 419 aa  300  2e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  52.82 
 
 		 474 aa  292  7e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  51.08 
 
 		 334 aa  292  8e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  49.4 
 
 		 338 aa  288  8e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  47.63 
 
 		 397 aa  275  7e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  50.29 
 
 		 346 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  51.16 
 
 		 337 aa  265  8.999999999999999e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 		 337 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  48.24 
 
 		 337 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11220  tellurium resistance membrane protein TerC  57.56 
 
 		 310 aa  256  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  40.46 
 
 		 328 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  39.51 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  44.71 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  41.35 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  39.29 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  39.94 
 
 		 321 aa  238  9e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  42.37 
 
 		 344 aa  238  9e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  40.98 
 
 		 331 aa  235  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  39.51 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  42.47 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  38.51 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  39.66 
 
 		 359 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  39.5 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  37.62 
 
 		 321 aa  233  5e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  44.2 
 
 		 339 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  38.98 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  42.81 
 
 		 337 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  39.04 
 
 		 344 aa  231  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  38.62 
 
 		 342 aa  229  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  40.39 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  39.94 
 
 		 318 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  39.83 
 
 		 334 aa  226  7e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  37.83 
 
 		 334 aa  225  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  39.68 
 
 		 307 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  39.61 
 
 		 322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  42.33 
 
 		 343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  41.14 
 
 		 313 aa  222  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  38.55 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  37.24 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  43.81 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  38.07 
 
 		 322 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  38.07 
 
 		 322 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  38.07 
 
 		 322 aa  219  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  43.53 
 
 		 313 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  44.03 
 
 		 312 aa  216  7e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  38.2 
 
 		 310 aa  216  7e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  37.61 
 
 		 322 aa  215  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  44.34 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  44.73 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  38.56 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  39.46 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  38.56 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  38.96 
 
 		 311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  41.64 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  40.18 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  40.06 
 
 		 314 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  37.79 
 
 		 311 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  43.02 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  36.71 
 
 		 319 aa  209  9e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  38.12 
 
 		 325 aa  208  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>