223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1104 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  100 
 
 
329 aa  657    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  62.61 
 
 
332 aa  431  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  59.7 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  63.38 
 
 
350 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  59.26 
 
 
330 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  57.67 
 
 
333 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  57.89 
 
 
352 aa  379  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  56.75 
 
 
333 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  56.31 
 
 
330 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  56.53 
 
 
330 aa  368  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  55.97 
 
 
352 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  55.62 
 
 
332 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  56.1 
 
 
332 aa  366  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  53.19 
 
 
399 aa  360  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  56.62 
 
 
360 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  56.92 
 
 
398 aa  358  5e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  56.35 
 
 
369 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  57.93 
 
 
341 aa  351  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  54.8 
 
 
342 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  54.91 
 
 
330 aa  348  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  57.32 
 
 
348 aa  347  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  52.1 
 
 
343 aa  346  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  53.21 
 
 
328 aa  343  2e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  52.11 
 
 
337 aa  342  5e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  54.8 
 
 
400 aa  340  1e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  56.29 
 
 
399 aa  340  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  57.41 
 
 
346 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  57.41 
 
 
346 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  57.41 
 
 
346 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  54.18 
 
 
399 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  54.18 
 
 
399 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  54.18 
 
 
399 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  53.05 
 
 
336 aa  332  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  51.22 
 
 
362 aa  332  8e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  57.72 
 
 
324 aa  331  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  53.25 
 
 
328 aa  329  5.0000000000000004e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  54.49 
 
 
348 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  51.85 
 
 
367 aa  315  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  51.08 
 
 
342 aa  315  7e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  50.77 
 
 
328 aa  315  7e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  53.31 
 
 
419 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  54.15 
 
 
474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  48.88 
 
 
397 aa  305  8.000000000000001e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  51.07 
 
 
334 aa  296  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  51.26 
 
 
338 aa  293  3e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  54.55 
 
 
337 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  52.04 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  43.44 
 
 
337 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  51.09 
 
 
337 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  52.98 
 
 
346 aa  260  2e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  42.77 
 
 
339 aa  253  3e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  46.73 
 
 
346 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.05 
 
 
325 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  43.47 
 
 
344 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  42.68 
 
 
360 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  43.61 
 
 
322 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  43.61 
 
 
322 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  43.61 
 
 
322 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  46.55 
 
 
334 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  42.68 
 
 
344 aa  246  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  43.75 
 
 
308 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  40.71 
 
 
306 aa  241  1e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  47.5 
 
 
346 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  39.81 
 
 
328 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  39.94 
 
 
331 aa  236  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  45.77 
 
 
322 aa  235  8e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  44.36 
 
 
329 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11220  tellurium resistance membrane protein TerC  54.75 
 
 
310 aa  230  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
307 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  37.61 
 
 
311 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  43.66 
 
 
334 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  37 
 
 
311 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  43.77 
 
 
313 aa  226  4e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  42.31 
 
 
312 aa  225  6e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  44.57 
 
 
342 aa  225  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  37.15 
 
 
310 aa  225  8e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  42.61 
 
 
335 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  44.26 
 
 
314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  38.32 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  39.88 
 
 
313 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  36.53 
 
 
320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  43.65 
 
 
373 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  43.73 
 
 
359 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  40.12 
 
 
321 aa  218  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  42.28 
 
 
321 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  38.26 
 
 
308 aa  217  2e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  43.06 
 
 
312 aa  217  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  38.67 
 
 
352 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  42.18 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  41.79 
 
 
314 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  38.32 
 
 
314 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  38.32 
 
 
314 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  40.8 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  42.15 
 
 
318 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  39.38 
 
 
318 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  42.14 
 
 
334 aa  211  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  40.4 
 
 
343 aa  211  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  43.35 
 
 
338 aa  208  1e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  39.4 
 
 
339 aa  206  4e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  41.01 
 
 
320 aa  205  8e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>