217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2025 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  100 
 
 		 337 aa  673    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  72.92 
 
 		 343 aa  499  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  54.1 
 
 		 330 aa  364  1e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  55.83 
 
 		 330 aa  356  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  52.1 
 
 		 332 aa  342  5e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  51.81 
 
 		 399 aa  340  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  51.5 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  52.71 
 
 		 330 aa  332  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  51.04 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  51.02 
 
 		 336 aa  328  9e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  53.78 
 
 		 350 aa  323  3e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  52.11 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  52.48 
 
 		 324 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  50.58 
 
 		 333 aa  316  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  50.15 
 
 		 332 aa  315  9e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  48.83 
 
 		 332 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  48.36 
 
 		 400 aa  309  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  50.45 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  50.61 
 
 		 352 aa  305  6e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  48.24 
 
 		 367 aa  305  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  51.66 
 
 		 360 aa  301  9e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  46.06 
 
 		 352 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  51.03 
 
 		 348 aa  299  4e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  47.13 
 
 		 369 aa  298  8e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  49.56 
 
 		 348 aa  297  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  47.2 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  50.61 
 
 		 341 aa  295  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  43.82 
 
 		 342 aa  292  7e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  49.56 
 
 		 346 aa  291  8e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  52.24 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  52.24 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  47.98 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  47.2 
 
 		 362 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  47.98 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  47.98 
 
 		 399 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  44.44 
 
 		 328 aa  285  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  48.9 
 
 		 338 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  47.15 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  48.38 
 
 		 419 aa  276  5e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  45.21 
 
 		 399 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  46.06 
 
 		 328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  47.39 
 
 		 342 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  46.52 
 
 		 337 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  50.87 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  45.43 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  44.69 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  45.72 
 
 		 397 aa  259  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  45.23 
 
 		 344 aa  258  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  46.86 
 
 		 337 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  49.08 
 
 		 474 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  43.07 
 
 		 329 aa  252  6e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  41.07 
 
 		 360 aa  252  7e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  49.14 
 
 		 337 aa  252  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  48.8 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  42.68 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  48.71 
 
 		 346 aa  246  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  41.03 
 
 		 331 aa  245  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  42.46 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  42.46 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  42.46 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  40.94 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  38.44 
 
 		 339 aa  238  9e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  45.85 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  39.76 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  41.85 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  40.91 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  41.3 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  44.25 
 
 		 308 aa  236  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  42.15 
 
 		 342 aa  233  5e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  46.35 
 
 		 346 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  38.63 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  38.01 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  40.76 
 
 		 338 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  40.25 
 
 		 306 aa  228  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  41.07 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  44.48 
 
 		 313 aa  227  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  41.55 
 
 		 318 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  40.12 
 
 		 322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  39.86 
 
 		 308 aa  226  6e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  39.61 
 
 		 359 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  40.24 
 
 		 321 aa  222  8e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  38.12 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  39.5 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  36.33 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1566  integral membrane protein TerC  41.72 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  44.3 
 
 		 373 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  39.45 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  39.45 
 
 		 325 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  39.45 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  39.45 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  38.26 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  44.37 
 
 		 343 aa  219  6e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  39.45 
 
 		 325 aa  219  7e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  36.66 
 
 		 354 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  37.95 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  37.25 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  41.72 
 
 		 314 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  36.78 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  40.06 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  42.91 
 
 		 339 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>