243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5477 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  100 
 
 
322 aa  637    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  100 
 
 
322 aa  637    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  100 
 
 
322 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  75.54 
 
 
335 aa  481  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  74.12 
 
 
322 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  77.56 
 
 
334 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  50 
 
 
325 aa  320  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  49.69 
 
 
339 aa  310  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  55.63 
 
 
334 aa  310  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  48.25 
 
 
360 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  49.38 
 
 
328 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  51.12 
 
 
342 aa  298  6e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  52.38 
 
 
344 aa  298  6e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  53.59 
 
 
313 aa  295  7e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  44.66 
 
 
321 aa  290  3e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  50.65 
 
 
344 aa  289  5.0000000000000004e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  50 
 
 
334 aa  288  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  45.36 
 
 
308 aa  288  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  48.54 
 
 
329 aa  286  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  49.67 
 
 
308 aa  285  5e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  44.16 
 
 
321 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  53.2 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  48.99 
 
 
312 aa  280  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  48.53 
 
 
314 aa  280  3e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  46.62 
 
 
322 aa  280  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  45.09 
 
 
331 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  47.85 
 
 
313 aa  276  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  45.82 
 
 
306 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  44.62 
 
 
330 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  45.9 
 
 
330 aa  267  1e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  45.25 
 
 
320 aa  266  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  44.24 
 
 
312 aa  263  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  43.23 
 
 
311 aa  263  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  45.15 
 
 
307 aa  261  8e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  42.81 
 
 
311 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  42.48 
 
 
311 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  44.55 
 
 
387 aa  259  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  45.94 
 
 
314 aa  259  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  44.41 
 
 
327 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  44.06 
 
 
333 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  43.71 
 
 
310 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  46.15 
 
 
330 aa  255  9e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  46.48 
 
 
318 aa  255  9e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  46.01 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  43.24 
 
 
350 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  48.25 
 
 
338 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  43.65 
 
 
328 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  45.11 
 
 
327 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  46.13 
 
 
314 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  44.84 
 
 
321 aa  248  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  45.66 
 
 
330 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  43.07 
 
 
333 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  44.9 
 
 
312 aa  248  1e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  42.67 
 
 
328 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  41.03 
 
 
343 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  42.27 
 
 
328 aa  246  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  41.34 
 
 
347 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  44.03 
 
 
325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  40.61 
 
 
346 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  40.19 
 
 
322 aa  245  6e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  41.61 
 
 
399 aa  245  8e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  46.01 
 
 
328 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  44.48 
 
 
327 aa  245  9e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  44.41 
 
 
325 aa  245  9e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  44.77 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  42.46 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  39.63 
 
 
354 aa  243  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  45.4 
 
 
348 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  43.57 
 
 
354 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  41.51 
 
 
325 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  44.05 
 
 
330 aa  241  9e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  44.52 
 
 
320 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  42.31 
 
 
318 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  41.42 
 
 
317 aa  240  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  43.9 
 
 
320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  42.21 
 
 
305 aa  239  5.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  43.21 
 
 
320 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  42.07 
 
 
354 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  41.39 
 
 
354 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  43.75 
 
 
317 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  41.59 
 
 
354 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  48.63 
 
 
337 aa  235  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  43.12 
 
 
328 aa  235  7e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  45.05 
 
 
327 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  42.31 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  49.32 
 
 
337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  41.12 
 
 
317 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0915  Integral membrane protein TerC  45 
 
 
307 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.92605e-32 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  41.72 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  39.63 
 
 
329 aa  231  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  41.96 
 
 
337 aa  231  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  42.43 
 
 
317 aa  231  2e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  42.01 
 
 
329 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  41.08 
 
 
352 aa  230  2e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  40.57 
 
 
332 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  43.09 
 
 
318 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  45.51 
 
 
332 aa  230  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  42.81 
 
 
320 aa  229  4e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  44.58 
 
 
337 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  42.86 
 
 
400 aa  228  7e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>