288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_10498 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  100 
 
 		 322 aa  635    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  59.75 
 
 		 324 aa  375  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  48.53 
 
 		 328 aa  300  2e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  46.84 
 
 		 320 aa  295  9e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  48.39 
 
 		 321 aa  294  1e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  48.52 
 
 		 314 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  47.76 
 
 		 318 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  46.13 
 
 		 321 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  46.36 
 
 		 328 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  47.12 
 
 		 311 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  47.3 
 
 		 329 aa  283  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  45.57 
 
 		 322 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  46.1 
 
 		 308 aa  281  9e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  45.36 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  43.81 
 
 		 331 aa  278  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  46.45 
 
 		 306 aa  278  7e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  46.67 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  45.83 
 
 		 311 aa  278  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  48.23 
 
 		 311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  44.65 
 
 		 321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  47.78 
 
 		 318 aa  271  8.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  45.69 
 
 		 307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  45.99 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  44.83 
 
 		 312 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  44.48 
 
 		 310 aa  265  7e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  50.38 
 
 		 440 aa  263  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  42.18 
 
 		 320 aa  262  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  44.86 
 
 		 313 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  39.63 
 
 		 354 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  42.18 
 
 		 320 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  43.3 
 
 		 320 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  43.38 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  43.38 
 
 		 327 aa  261  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  42.94 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  40.91 
 
 		 339 aa  258  7e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  43.48 
 
 		 325 aa  258  7e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  43.17 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2152  integral membrane protein TerC  42.63 
 
 		 405 aa  256  3e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.305703  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  44.41 
 
 		 329 aa  256  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  43.12 
 
 		 328 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  44.13 
 
 		 317 aa  256  5e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  43.12 
 
 		 328 aa  255  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 		 325 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  43.12 
 
 		 328 aa  255  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  44.41 
 
 		 346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  42.86 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  42.9 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  45.45 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  45.98 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  45.99 
 
 		 347 aa  253  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  42.81 
 
 		 328 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  42.11 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  43.21 
 
 		 328 aa  252  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  43.12 
 
 		 354 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  43.75 
 
 		 334 aa  252  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  42.68 
 
 		 322 aa  251  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  44.03 
 
 		 321 aa  251  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  40.56 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  41.14 
 
 		 344 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  42.68 
 
 		 322 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  41.54 
 
 		 330 aa  250  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  44.55 
 
 		 327 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  41.46 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  43.69 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  45.86 
 
 		 373 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  43.69 
 
 		 320 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  43.69 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  43.69 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  43.69 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  43.69 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  43.69 
 
 		 321 aa  249  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  43.69 
 
 		 321 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  42.37 
 
 		 330 aa  248  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  42.77 
 
 		 317 aa  249  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  44.44 
 
 		 313 aa  248  7e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  42.37 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  42.37 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  42.37 
 
 		 337 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  44 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  42.72 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  40.19 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  42.3 
 
 		 325 aa  246  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  40.19 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  40.19 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  38.82 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  41.04 
 
 		 317 aa  245  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  43.81 
 
 		 317 aa  244  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  42.07 
 
 		 354 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  44.23 
 
 		 327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5754  Integral membrane protein TerC  42.27 
 
 		 354 aa  243  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  44.03 
 
 		 314 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  42.41 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  42.07 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  41.9 
 
 		 354 aa  241  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  42.49 
 
 		 325 aa  242  7.999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  44.88 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  40 
 
 		 329 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  40.76 
 
 		 316 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  41.04 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4581  Integral membrane protein TerC  41.11 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>