236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5754 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5754  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 354 aa  706    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4581  Integral membrane protein TerC  62.78 
 
 		 357 aa  456  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  41.42 
 
 		 322 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  44.94 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  41.71 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  41.24 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  41.71 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  41.93 
 
 		 321 aa  253  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  41.08 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  41.85 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  40 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  40 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  39.94 
 
 		 306 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  39.44 
 
 		 307 aa  246  6e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  39.44 
 
 		 310 aa  246  6e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  39.71 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  42.27 
 
 		 322 aa  243  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  41.36 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  40.59 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  39.54 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  42.7 
 
 		 313 aa  241  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  40.06 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  43.63 
 
 		 314 aa  241  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  40.06 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  39.65 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  39.47 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  48.26 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  41.43 
 
 		 312 aa  236  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  39.89 
 
 		 317 aa  234  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  40.63 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  38.66 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  41.44 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  40.59 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  39.71 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  40.39 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  40.39 
 
 		 322 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  40.39 
 
 		 337 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  40.54 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  40.07 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  36.75 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  40.07 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  40.3 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  39.94 
 
 		 321 aa  226  7e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  39.94 
 
 		 321 aa  226  7e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  39.94 
 
 		 321 aa  225  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  39.94 
 
 		 321 aa  225  8e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  39.94 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  39.94 
 
 		 321 aa  225  9e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  39.94 
 
 		 321 aa  225  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  39.94 
 
 		 321 aa  225  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  40.32 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  39.6 
 
 		 317 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  39.94 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  46.85 
 
 		 312 aa  224  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  40.59 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  37.96 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  41.21 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  42.24 
 
 		 320 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  40.95 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  39.26 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  47.3 
 
 		 347 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  38.54 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  43.26 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  36.83 
 
 		 354 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  40.65 
 
 		 334 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  39 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  37.86 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  40.39 
 
 		 322 aa  215  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  37.54 
 
 		 320 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  39.47 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  38.66 
 
 		 318 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  38.42 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  37.62 
 
 		 320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  35.82 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  47.03 
 
 		 354 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  43.85 
 
 		 352 aa  212  9e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  47.03 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  36.49 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  46.12 
 
 		 354 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  46.12 
 
 		 354 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  38.94 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  38.36 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  41.57 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  34.08 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  35.06 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  37.46 
 
 		 327 aa  202  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  38.61 
 
 		 338 aa  202  8e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  40.83 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  37.17 
 
 		 344 aa  202  8e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  37.78 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  35.33 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  35.56 
 
 		 330 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  35.96 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  35.96 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  37.46 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  35.07 
 
 		 329 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  38.28 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  44.5 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  38.28 
 
 		 314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  33.43 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>