231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4581 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4581  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 357 aa  701    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5754  Integral membrane protein TerC  62.78 
 
 		 354 aa  456  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  46.55 
 
 		 328 aa  278  1e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  43.57 
 
 		 318 aa  275  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  44.01 
 
 		 322 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  43.55 
 
 		 312 aa  265  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  43.3 
 
 		 331 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  41.91 
 
 		 307 aa  259  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  41.74 
 
 		 311 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  46.67 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  41.25 
 
 		 311 aa  257  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  41.33 
 
 		 306 aa  256  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  42.86 
 
 		 314 aa  255  8e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  41.21 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  42.06 
 
 		 313 aa  252  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  51.19 
 
 		 440 aa  242  6e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  41.76 
 
 		 312 aa  242  7.999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  42.94 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  41.14 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  39.94 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  39.94 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  40.9 
 
 		 314 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  43.85 
 
 		 321 aa  238  9e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  41.11 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  40.46 
 
 		 311 aa  237  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  40.18 
 
 		 321 aa  237  3e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  40.06 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  40.85 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  40 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  47.97 
 
 		 312 aa  230  3e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  39.41 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  36.96 
 
 		 318 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  37.17 
 
 		 325 aa  222  9e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  37.86 
 
 		 314 aa  222  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  36.95 
 
 		 325 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  38.76 
 
 		 305 aa  221  1.9999999999999999e-56  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  37.65 
 
 		 320 aa  219  6e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  36.78 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  36.78 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  36.62 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  36.78 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  37.71 
 
 		 359 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  36.62 
 
 		 320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  36.49 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  37.64 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  36.62 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  37.11 
 
 		 321 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  37.11 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  36.21 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  37.68 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  40.35 
 
 		 313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  37.68 
 
 		 321 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  36.78 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  37.68 
 
 		 321 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  36.78 
 
 		 320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  36.78 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  38.51 
 
 		 338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  37.39 
 
 		 321 aa  212  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  40.06 
 
 		 325 aa  212  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  35.78 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  35.48 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  36.36 
 
 		 317 aa  209  8e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  37.68 
 
 		 318 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  37.24 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  36.07 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  39.66 
 
 		 315 aa  206  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  36.78 
 
 		 318 aa  206  7e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  43.51 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  43.92 
 
 		 346 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  37.03 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  38.53 
 
 		 317 aa  203  5e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  36.21 
 
 		 322 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  39.51 
 
 		 325 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  33.05 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  36.28 
 
 		 316 aa  199  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  41.47 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  40.86 
 
 		 354 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  42.8 
 
 		 354 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  36.36 
 
 		 325 aa  199  9e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  40.62 
 
 		 354 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  43.33 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  38.53 
 
 		 317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  36.5 
 
 		 329 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  39.36 
 
 		 286 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  35.58 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  35.58 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1943  Integral membrane protein TerC  36.05 
 
 		 332 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153344 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  39.86 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  35.82 
 
 		 335 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  39.69 
 
 		 352 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  34.31 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  33.71 
 
 		 328 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  34.02 
 
 		 337 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  31.82 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  37.5 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  40.16 
 
 		 279 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  35.24 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  37.81 
 
 		 327 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  34.67 
 
 		 360 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  37.97 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>