233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1943 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1943  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 332 aa  647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153344 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  47.8 
 
 		 321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  46.86 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  48.54 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  46.67 
 
 		 308 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  44.38 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  47.55 
 
 		 318 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  42.5 
 
 		 311 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  43.15 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  43.08 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  44.34 
 
 		 311 aa  252  7e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  42.81 
 
 		 322 aa  251  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  42.72 
 
 		 306 aa  250  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  44.34 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  45.62 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  42.59 
 
 		 307 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  41.96 
 
 		 311 aa  246  4e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  43.47 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  44.31 
 
 		 360 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  44.3 
 
 		 339 aa  243  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  40.41 
 
 		 337 aa  242  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  40.41 
 
 		 322 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  41.46 
 
 		 328 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  40.41 
 
 		 322 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  40.12 
 
 		 322 aa  241  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  43.48 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  43.56 
 
 		 314 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  41.14 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  40.12 
 
 		 322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  42.59 
 
 		 320 aa  239  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  40.95 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  43.89 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  42.41 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  40.95 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  42.41 
 
 		 321 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  42.41 
 
 		 320 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  42.41 
 
 		 321 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  42.41 
 
 		 321 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  42.11 
 
 		 321 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  44.68 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  42.11 
 
 		 321 aa  237  2e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  42.99 
 
 		 312 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  44.41 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  40.95 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  42.81 
 
 		 359 aa  230  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  45.13 
 
 		 314 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  43.23 
 
 		 338 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  41.43 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  44.44 
 
 		 334 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  39.44 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  42.21 
 
 		 318 aa  226  3e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  41.96 
 
 		 322 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  41.64 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  39.29 
 
 		 322 aa  226  6e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  41.24 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  39.34 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  42.28 
 
 		 314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  44.01 
 
 		 313 aa  222  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  40.47 
 
 		 325 aa  221  9.999999999999999e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  41.69 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  41.14 
 
 		 313 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  37.61 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  39.34 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.78 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  39.93 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  41.64 
 
 		 317 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  39.51 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  39.26 
 
 		 320 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  39.26 
 
 		 320 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4581  Integral membrane protein TerC  37.78 
 
 		 357 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  39.17 
 
 		 319 aa  212  7e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  41.18 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  38.41 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  40.06 
 
 		 320 aa  211  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  42.07 
 
 		 334 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  38.11 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  38.11 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  38.11 
 
 		 322 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  40.92 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  39.76 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  38.08 
 
 		 334 aa  208  8e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  39.47 
 
 		 344 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  38.26 
 
 		 315 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  36.78 
 
 		 337 aa  205  7e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  38.89 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  37.93 
 
 		 342 aa  203  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  38.18 
 
 		 330 aa  203  4e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  42.76 
 
 		 279 aa  202  9e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  40.62 
 
 		 329 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  38.93 
 
 		 373 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  37.94 
 
 		 347 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1566  integral membrane protein TerC  40.13 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  38.07 
 
 		 400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  38.12 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  36.09 
 
 		 339 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  37.83 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  39.42 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  39.42 
 
 		 314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  39.31 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>