228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2946 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  100 
 
 
322 aa  631  1e-180  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  85.05 
 
 
334 aa  548  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  84 
 
 
335 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  74.12 
 
 
322 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  74.12 
 
 
322 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  74.12 
 
 
322 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  54.55 
 
 
313 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  51.31 
 
 
328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  49.36 
 
 
325 aa  295  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  54.32 
 
 
308 aa  291  9e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
329 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  48.79 
 
 
334 aa  287  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  50.49 
 
 
344 aa  287  2e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  49.22 
 
 
334 aa  285  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  43.04 
 
 
321 aa  281  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  47.84 
 
 
342 aa  281  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  42.9 
 
 
321 aa  280  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  48.42 
 
 
320 aa  279  4e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  46.6 
 
 
331 aa  277  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  42.72 
 
 
308 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  48.54 
 
 
344 aa  275  9e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  50.64 
 
 
373 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  45.86 
 
 
311 aa  271  1e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  46.42 
 
 
322 aa  270  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  46.86 
 
 
314 aa  268  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  44.26 
 
 
360 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  45.27 
 
 
306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  44.44 
 
 
313 aa  264  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  44.04 
 
 
339 aa  263  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  42.04 
 
 
311 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  46.76 
 
 
318 aa  259  4e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  44.26 
 
 
307 aa  258  8e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  42.04 
 
 
311 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  47 
 
 
330 aa  256  5e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  43.92 
 
 
310 aa  255  8e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  45.33 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  42.31 
 
 
312 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  42.77 
 
 
387 aa  253  3e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  44.55 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  43.47 
 
 
330 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  42.41 
 
 
400 aa  248  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  43.16 
 
 
333 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  39.94 
 
 
399 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  45.14 
 
 
320 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  40.48 
 
 
354 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  43.79 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  42.26 
 
 
318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  41.21 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  39.56 
 
 
354 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  43.05 
 
 
346 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  44.05 
 
 
318 aa  242  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  43 
 
 
330 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  43.67 
 
 
347 aa  242  6e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  42.63 
 
 
327 aa  241  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  43 
 
 
312 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  41.32 
 
 
350 aa  239  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  40.85 
 
 
354 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  43.4 
 
 
320 aa  238  8e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  43.56 
 
 
317 aa  238  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  41.3 
 
 
337 aa  237  2e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  43.4 
 
 
320 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  42.9 
 
 
327 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  43.41 
 
 
328 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  41.05 
 
 
399 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  41.05 
 
 
399 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  41.05 
 
 
399 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  43.51 
 
 
329 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  41.41 
 
 
322 aa  235  8e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  41.46 
 
 
354 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  43.67 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  43.33 
 
 
317 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  39.34 
 
 
333 aa  233  3e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  42.32 
 
 
328 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  41.8 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  38.71 
 
 
343 aa  232  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  43.75 
 
 
334 aa  232  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  40.88 
 
 
325 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  40.13 
 
 
317 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  41.64 
 
 
332 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  42.09 
 
 
305 aa  230  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  42.06 
 
 
330 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  46.04 
 
 
328 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  42.72 
 
 
338 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  41.72 
 
 
328 aa  229  4e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  43.61 
 
 
323 aa  229  4e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  41.33 
 
 
398 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  42.67 
 
 
317 aa  228  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  40.62 
 
 
325 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  41.27 
 
 
322 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  41.38 
 
 
352 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  40.61 
 
 
367 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  41.16 
 
 
320 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  40.95 
 
 
322 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  42.07 
 
 
330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  41.94 
 
 
327 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  40.95 
 
 
322 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  40.95 
 
 
322 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  42.56 
 
 
338 aa  225  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  45.33 
 
 
319 aa  225  9e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>