257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1897 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
339 aa  669    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  68.6 
 
 
360 aa  467  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  53.98 
 
 
334 aa  322  6e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  53.99 
 
 
373 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  49.69 
 
 
322 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  49.69 
 
 
322 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  49.69 
 
 
322 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  47.76 
 
 
328 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  45 
 
 
321 aa  301  1e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  45 
 
 
344 aa  298  8e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  44.38 
 
 
321 aa  296  3e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  45.22 
 
 
308 aa  295  1e-78  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  46.81 
 
 
325 aa  291  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  49.62 
 
 
334 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  44.64 
 
 
342 aa  279  5e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  44.65 
 
 
320 aa  278  9e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  44.17 
 
 
331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  46.84 
 
 
313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  42.99 
 
 
344 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  43.54 
 
 
335 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  46.73 
 
 
329 aa  268  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  40.6 
 
 
387 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  44.79 
 
 
334 aa  267  2e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  43.75 
 
 
348 aa  263  3e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  44.04 
 
 
322 aa  263  3e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  45.7 
 
 
305 aa  261  8.999999999999999e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  45.91 
 
 
322 aa  261  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  40.91 
 
 
322 aa  258  8e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  45.57 
 
 
321 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  41.27 
 
 
330 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  41.88 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  43.89 
 
 
334 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  41.09 
 
 
399 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  42.42 
 
 
333 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  41.46 
 
 
352 aa  249  6e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  42.24 
 
 
308 aa  248  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  40.75 
 
 
311 aa  247  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  44.97 
 
 
313 aa  245  6e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  42.36 
 
 
324 aa  246  6e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  40.46 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  41.29 
 
 
311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  40.43 
 
 
330 aa  243  3.9999999999999997e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  43.44 
 
 
338 aa  243  5e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  40.51 
 
 
310 aa  242  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  45.65 
 
 
327 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  39.45 
 
 
343 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  41.23 
 
 
328 aa  241  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  42.54 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  43.17 
 
 
362 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  42.14 
 
 
306 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  39.46 
 
 
336 aa  239  5.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  40.95 
 
 
330 aa  239  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  38.44 
 
 
337 aa  238  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  43.62 
 
 
314 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  41.18 
 
 
314 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  44.58 
 
 
329 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  42.49 
 
 
354 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  40.97 
 
 
318 aa  238  2e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  39.12 
 
 
354 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  41.39 
 
 
332 aa  236  4e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  42.41 
 
 
330 aa  236  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  41.16 
 
 
325 aa  235  7e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  43.26 
 
 
312 aa  235  7e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  41.51 
 
 
333 aa  235  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  42.81 
 
 
327 aa  235  9e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  41.81 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  42.45 
 
 
317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1943  Integral membrane protein TerC  44.3 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153344 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  39.6 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  43.24 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  42.95 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  39.52 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  42.45 
 
 
317 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  44 
 
 
342 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  41.88 
 
 
317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  40.69 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  41.98 
 
 
332 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  39.76 
 
 
328 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  43.37 
 
 
330 aa  233  5e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  43.83 
 
 
322 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  40.57 
 
 
337 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  42.19 
 
 
327 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  40.58 
 
 
312 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  44.24 
 
 
314 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  43.04 
 
 
323 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  41.35 
 
 
369 aa  231  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  43.83 
 
 
322 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  42.46 
 
 
329 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  39.36 
 
 
398 aa  231  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  43.83 
 
 
322 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  43.83 
 
 
322 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  41.46 
 
 
359 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  43.83 
 
 
337 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  42.77 
 
 
329 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  39.53 
 
 
346 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  39.53 
 
 
346 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  41.82 
 
 
325 aa  229  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  40.99 
 
 
327 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  39.53 
 
 
346 aa  229  6e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>