216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  100 
 
 
400 aa  801    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  70 
 
 
398 aa  547  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  70.26 
 
 
399 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  64.34 
 
 
399 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  64.34 
 
 
399 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  64.34 
 
 
399 aa  524  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  58.27 
 
 
397 aa  464  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  58.21 
 
 
419 aa  442  1e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  56.05 
 
 
474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  63.86 
 
 
387 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  60.3 
 
 
332 aa  390  1e-107  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  57.82 
 
 
350 aa  386  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  60.13 
 
 
352 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  56.55 
 
 
333 aa  375  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  58.75 
 
 
333 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  58.88 
 
 
330 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  59.18 
 
 
330 aa  364  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  54.71 
 
 
332 aa  347  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  47.57 
 
 
399 aa  346  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  54.71 
 
 
332 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  55.86 
 
 
341 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  52.29 
 
 
348 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  57.05 
 
 
330 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  56.11 
 
 
346 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  54.21 
 
 
352 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  56.11 
 
 
346 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  53.25 
 
 
346 aa  331  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  53.77 
 
 
328 aa  321  9.999999999999999e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  54.32 
 
 
369 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  51 
 
 
360 aa  318  9e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  54.8 
 
 
329 aa  316  6e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  53.95 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  49.09 
 
 
342 aa  309  4e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  49.57 
 
 
367 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  48.36 
 
 
337 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  53.9 
 
 
342 aa  305  7e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  48.04 
 
 
343 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  52.63 
 
 
328 aa  297  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  53.08 
 
 
336 aa  296  5e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  48.75 
 
 
348 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  52.04 
 
 
338 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  52.8 
 
 
330 aa  288  9e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  51.88 
 
 
328 aa  285  7e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
324 aa  282  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  53.61 
 
 
337 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  51.1 
 
 
334 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  54.86 
 
 
337 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  43.61 
 
 
328 aa  259  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  41.12 
 
 
335 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  51.1 
 
 
337 aa  251  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  42.28 
 
 
334 aa  251  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  42.41 
 
 
322 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  50.49 
 
 
346 aa  247  3e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  43.63 
 
 
360 aa  243  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  39.6 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  38.53 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  42.38 
 
 
313 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  41.74 
 
 
337 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
322 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
322 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
322 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  40.13 
 
 
329 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  41.85 
 
 
311 aa  227  2e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  39.87 
 
 
331 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  38.92 
 
 
344 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  38.75 
 
 
321 aa  225  8e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  39.58 
 
 
318 aa  225  9e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  37.62 
 
 
321 aa  225  9e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4839  Integral membrane protein TerC  46.04 
 
 
316 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  38.46 
 
 
308 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  36.45 
 
 
306 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  41.5 
 
 
313 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  38.58 
 
 
344 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  40.85 
 
 
314 aa  219  7e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  41 
 
 
334 aa  218  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  45.79 
 
 
346 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  37.18 
 
 
307 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  37.46 
 
 
320 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11220  tellurium resistance membrane protein TerC  50.91 
 
 
310 aa  216  7e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  38.96 
 
 
320 aa  216  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  41.72 
 
 
334 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  38.18 
 
 
314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  38.18 
 
 
314 aa  213  4.9999999999999996e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  41.67 
 
 
314 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  37.33 
 
 
322 aa  211  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  34.95 
 
 
311 aa  210  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  37.5 
 
 
319 aa  209  6e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  36.91 
 
 
310 aa  209  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  41.64 
 
 
305 aa  209  6e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  37.65 
 
 
325 aa  209  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  38.33 
 
 
308 aa  209  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  38.27 
 
 
342 aa  209  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  37.84 
 
 
311 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  39.31 
 
 
312 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  42.75 
 
 
359 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  39.24 
 
 
338 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  37.99 
 
 
312 aa  207  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  38.36 
 
 
318 aa  207  3e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  42.34 
 
 
314 aa  207  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  41.72 
 
 
373 aa  206  6e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>