247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2919 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
337 aa  660    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  79.4 
 
 
338 aa  512  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  79.94 
 
 
334 aa  499  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  78.68 
 
 
337 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  70.03 
 
 
337 aa  423  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  61.13 
 
 
348 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  55.62 
 
 
330 aa  330  2e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  53.12 
 
 
330 aa  323  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  52.44 
 
 
333 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  53.07 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  55.05 
 
 
330 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  51.75 
 
 
346 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  51.75 
 
 
346 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  51.75 
 
 
346 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  51.52 
 
 
333 aa  315  6e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  49.27 
 
 
399 aa  314  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  48.71 
 
 
350 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  50.96 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  52.35 
 
 
387 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  51.57 
 
 
399 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  51.57 
 
 
399 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  51.57 
 
 
399 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  48.71 
 
 
348 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  51.58 
 
 
337 aa  300  3e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  49.21 
 
 
343 aa  298  7e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  51.1 
 
 
400 aa  298  7e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  49.84 
 
 
352 aa  297  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  49.23 
 
 
332 aa  297  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  50.62 
 
 
332 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  49.56 
 
 
341 aa  297  2e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  50.62 
 
 
332 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  49.69 
 
 
328 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  53.25 
 
 
324 aa  295  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  48.9 
 
 
337 aa  295  7e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  47.88 
 
 
352 aa  293  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  53.14 
 
 
329 aa  292  5e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  50.96 
 
 
369 aa  289  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  44.41 
 
 
342 aa  286  2.9999999999999996e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  48.48 
 
 
367 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  46.42 
 
 
360 aa  279  6e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  48.18 
 
 
398 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  47.31 
 
 
399 aa  276  5e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  51.82 
 
 
346 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  50.17 
 
 
419 aa  272  5.000000000000001e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  47.63 
 
 
328 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  45.86 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  47.62 
 
 
322 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  47.62 
 
 
322 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  47.62 
 
 
322 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  44.78 
 
 
335 aa  259  7e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  44.79 
 
 
362 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  45.09 
 
 
329 aa  256  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  44.41 
 
 
328 aa  256  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  44.51 
 
 
334 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  45.15 
 
 
360 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  44.25 
 
 
397 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  45.16 
 
 
344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  52.05 
 
 
346 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  43.95 
 
 
342 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  46.84 
 
 
334 aa  249  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  43.37 
 
 
325 aa  248  9e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  43.08 
 
 
331 aa  246  4e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  44.51 
 
 
322 aa  245  8e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  47.34 
 
 
346 aa  242  5e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  45.28 
 
 
314 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  45.21 
 
 
342 aa  240  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  45.7 
 
 
313 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  39.56 
 
 
321 aa  239  5e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  40.99 
 
 
339 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  46.39 
 
 
334 aa  239  6.999999999999999e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  41.08 
 
 
320 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  40.13 
 
 
321 aa  236  3e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  48.05 
 
 
474 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  43.62 
 
 
344 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  43.61 
 
 
312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  45.15 
 
 
314 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  45.19 
 
 
318 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  41.37 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  42.43 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  42.19 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  41.18 
 
 
311 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  39.81 
 
 
320 aa  231  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
308 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  43.42 
 
 
318 aa  229  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  39.68 
 
 
306 aa  229  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  43.45 
 
 
318 aa  228  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  40.26 
 
 
308 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  44.34 
 
 
321 aa  227  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  38.8 
 
 
311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  42.52 
 
 
314 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  45.52 
 
 
312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  40.58 
 
 
325 aa  225  7e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  40.32 
 
 
328 aa  225  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  40.06 
 
 
325 aa  225  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  46.79 
 
 
373 aa  225  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  40.06 
 
 
325 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  40.32 
 
 
328 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  40.32 
 
 
328 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
327 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
325 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>