238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4871 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  100 
 
 
346 aa  696    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  100 
 
 
346 aa  696    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  99.71 
 
 
346 aa  694    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  76.47 
 
 
341 aa  509  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  74.64 
 
 
348 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  63.36 
 
 
352 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  59.71 
 
 
342 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  56.94 
 
 
350 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  66.23 
 
 
369 aa  382  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  56.42 
 
 
332 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  58.04 
 
 
332 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  57.88 
 
 
332 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  54.65 
 
 
399 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  56.23 
 
 
362 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  58.07 
 
 
387 aa  363  2e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  57.83 
 
 
342 aa  359  3e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  57.32 
 
 
333 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  54.71 
 
 
330 aa  355  7.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  51.99 
 
 
352 aa  354  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  52.6 
 
 
398 aa  346  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  56.56 
 
 
330 aa  346  3e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  51.72 
 
 
399 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  51.72 
 
 
399 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  51.72 
 
 
399 aa  345  5e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  56.63 
 
 
328 aa  345  6e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  56.56 
 
 
400 aa  344  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  53.5 
 
 
333 aa  343  4e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  52.91 
 
 
330 aa  336  2.9999999999999997e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  52.59 
 
 
360 aa  335  7.999999999999999e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  52.02 
 
 
399 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  53.41 
 
 
330 aa  332  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  57.41 
 
 
329 aa  328  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  55.24 
 
 
328 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  51.58 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  50.59 
 
 
367 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  50.58 
 
 
336 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  50 
 
 
419 aa  316  4e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  48.57 
 
 
343 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  52.24 
 
 
337 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  53.12 
 
 
324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  48.97 
 
 
338 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  45.48 
 
 
397 aa  295  6e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  49.85 
 
 
334 aa  295  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  47.65 
 
 
348 aa  291  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  49.42 
 
 
474 aa  290  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  51.75 
 
 
337 aa  288  9e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  48.99 
 
 
337 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  41.04 
 
 
360 aa  257  2e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  49.07 
 
 
337 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  47.34 
 
 
346 aa  245  6.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  39.53 
 
 
339 aa  245  9.999999999999999e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11220  tellurium resistance membrane protein TerC  55.05 
 
 
310 aa  241  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  40.87 
 
 
328 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  41.19 
 
 
337 aa  239  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  46.56 
 
 
346 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  36.44 
 
 
354 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  37.22 
 
 
354 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  37.04 
 
 
354 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  39.47 
 
 
344 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  38.42 
 
 
325 aa  233  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  40 
 
 
344 aa  232  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  38.51 
 
 
321 aa  232  8.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  35.88 
 
 
354 aa  232  9e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  39.81 
 
 
331 aa  231  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  37.61 
 
 
321 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  38.18 
 
 
334 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  39.69 
 
 
306 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  46.25 
 
 
346 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  38.41 
 
 
308 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  41.1 
 
 
313 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  37.46 
 
 
334 aa  222  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  39.23 
 
 
329 aa  222  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  36.73 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  37.43 
 
 
335 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  41.32 
 
 
312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  37 
 
 
347 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  38.96 
 
 
321 aa  218  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  40.91 
 
 
314 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  39.88 
 
 
322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  39.88 
 
 
322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  39.88 
 
 
322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  36.96 
 
 
327 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  36.96 
 
 
327 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  37.15 
 
 
328 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  36.99 
 
 
346 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  37.15 
 
 
328 aa  215  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  37.15 
 
 
328 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  37.77 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  37.13 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  40.19 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  37.62 
 
 
320 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  37.07 
 
 
311 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  38.46 
 
 
342 aa  213  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  36.88 
 
 
325 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  37.42 
 
 
320 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  36.56 
 
 
325 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  36.84 
 
 
328 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  35.14 
 
 
330 aa  211  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  38.97 
 
 
322 aa  211  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  37.07 
 
 
327 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>