229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1249 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
330 aa  655    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  65.11 
 
 
333 aa  431  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  64.51 
 
 
333 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  61.99 
 
 
352 aa  428  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  64.6 
 
 
330 aa  421  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  61.93 
 
 
387 aa  415  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  53.94 
 
 
332 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  60.54 
 
 
328 aa  366  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  56.84 
 
 
350 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  59.18 
 
 
400 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  55.96 
 
 
398 aa  360  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  56.88 
 
 
399 aa  358  6e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  57.19 
 
 
330 aa  354  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  55.21 
 
 
399 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  55.21 
 
 
399 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  55.21 
 
 
399 aa  349  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  55.24 
 
 
399 aa  346  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  55.45 
 
 
360 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  56.53 
 
 
329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  53.8 
 
 
332 aa  338  5e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  53.21 
 
 
332 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  53.25 
 
 
397 aa  331  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  54.43 
 
 
369 aa  330  2e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  56.38 
 
 
362 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  51.24 
 
 
342 aa  330  3e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  49.85 
 
 
352 aa  326  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  52.84 
 
 
419 aa  325  9e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  52.44 
 
 
348 aa  322  4e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  55.14 
 
 
342 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  52.91 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  49.7 
 
 
367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  52.91 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  52.91 
 
 
346 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  51.77 
 
 
328 aa  318  6e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  54.72 
 
 
474 aa  315  8e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  51.23 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  51.69 
 
 
336 aa  312  3.9999999999999997e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  50.45 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  52.05 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  51.92 
 
 
328 aa  306  3e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  52.8 
 
 
348 aa  299  4e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  47.31 
 
 
343 aa  295  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
338 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  48.17 
 
 
334 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  51.06 
 
 
324 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  52.65 
 
 
337 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  50.96 
 
 
337 aa  267  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  49.22 
 
 
337 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  44.04 
 
 
337 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  46.15 
 
 
322 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  46.15 
 
 
322 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.3 
 
 
325 aa  255  9e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  46.15 
 
 
322 aa  255  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  42.17 
 
 
344 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  46.15 
 
 
334 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  40.91 
 
 
344 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  41.64 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  42.9 
 
 
360 aa  243  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  43 
 
 
322 aa  243  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  45.28 
 
 
321 aa  241  1e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  47.89 
 
 
346 aa  241  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  41.72 
 
 
334 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  45.28 
 
 
329 aa  239  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
328 aa  239  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  40.95 
 
 
339 aa  239  5e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  41.4 
 
 
335 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  45.2 
 
 
320 aa  235  9e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  41.43 
 
 
313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  40.32 
 
 
308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  45.28 
 
 
346 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  49.65 
 
 
346 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  46.64 
 
 
318 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  40.75 
 
 
308 aa  230  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  44.77 
 
 
314 aa  229  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  43.06 
 
 
311 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  37.46 
 
 
306 aa  228  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  44.94 
 
 
331 aa  227  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  39.05 
 
 
313 aa  228  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  40.43 
 
 
321 aa  225  8e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  41.95 
 
 
322 aa  224  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  40.13 
 
 
312 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  38.6 
 
 
342 aa  222  7e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  38.08 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  36.25 
 
 
322 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  36.83 
 
 
307 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  47.97 
 
 
373 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  35.94 
 
 
322 aa  219  7e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  35.94 
 
 
337 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  35.94 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  35.94 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  40.71 
 
 
305 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  36.65 
 
 
321 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  36.65 
 
 
321 aa  217  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  36.65 
 
 
321 aa  217  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  36.65 
 
 
321 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  37.73 
 
 
320 aa  217  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  36.65 
 
 
321 aa  217  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11220  tellurium resistance membrane protein TerC  50.23 
 
 
310 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  36.65 
 
 
320 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  40.51 
 
 
314 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>