234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2416 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
313 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  61.61 
 
 
325 aa  360  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  55.56 
 
 
331 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  60.44 
 
 
334 aa  346  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  57.65 
 
 
329 aa  342  5.999999999999999e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  55.99 
 
 
335 aa  338  7e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  55.92 
 
 
328 aa  338  9.999999999999999e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  59.2 
 
 
308 aa  334  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  55.02 
 
 
334 aa  334  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  56.38 
 
 
314 aa  331  8e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  53.61 
 
 
320 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  54.87 
 
 
322 aa  331  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  51.01 
 
 
321 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  50.49 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  48.99 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  51.77 
 
 
322 aa  325  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  57.74 
 
 
344 aa  325  8.000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  55.52 
 
 
312 aa  321  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  51.4 
 
 
308 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  50.65 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  52.72 
 
 
321 aa  318  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  58.36 
 
 
342 aa  318  6e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  55.74 
 
 
344 aa  317  2e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  57.75 
 
 
328 aa  316  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  56.39 
 
 
334 aa  316  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  50 
 
 
306 aa  316  4e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  53.93 
 
 
318 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  48.87 
 
 
311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  57.04 
 
 
328 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  49.51 
 
 
307 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  53.59 
 
 
322 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  53.59 
 
 
322 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  53.59 
 
 
322 aa  311  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  53.16 
 
 
318 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  55.19 
 
 
373 aa  304  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  50.32 
 
 
359 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  56.62 
 
 
328 aa  299  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
312 aa  293  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  49.68 
 
 
325 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  49.08 
 
 
347 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  51.64 
 
 
346 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  46.43 
 
 
311 aa  290  3e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  49.68 
 
 
325 aa  288  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  50 
 
 
323 aa  285  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  47.81 
 
 
352 aa  285  8e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  50 
 
 
327 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  46.56 
 
 
360 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  47.8 
 
 
330 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  49.34 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  46.93 
 
 
317 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  48.24 
 
 
325 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  46.84 
 
 
339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  50.18 
 
 
320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  50 
 
 
327 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  47.59 
 
 
320 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  50.18 
 
 
320 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  51.19 
 
 
312 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  46.93 
 
 
317 aa  280  2e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  49.82 
 
 
320 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  50.33 
 
 
322 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  50.68 
 
 
327 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  44.86 
 
 
322 aa  279  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  46.82 
 
 
320 aa  278  1e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  44.62 
 
 
327 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  50 
 
 
322 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  50 
 
 
322 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  47.76 
 
 
329 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  50 
 
 
322 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  49.84 
 
 
334 aa  276  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  50 
 
 
337 aa  276  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  50.52 
 
 
314 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  46.75 
 
 
330 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  47.1 
 
 
354 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  45.05 
 
 
324 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  48.4 
 
 
321 aa  275  8e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  51.03 
 
 
321 aa  275  9e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  51.03 
 
 
320 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  51.03 
 
 
321 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  51.03 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  51.03 
 
 
321 aa  274  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  44.44 
 
 
305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  50.69 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  50.69 
 
 
321 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  44.77 
 
 
317 aa  273  3e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  46.25 
 
 
317 aa  273  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  50.69 
 
 
321 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
329 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  48.71 
 
 
314 aa  271  7e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  45.6 
 
 
317 aa  271  8.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  46.75 
 
 
354 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  46.33 
 
 
325 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  45.63 
 
 
354 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  46.03 
 
 
327 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  46.03 
 
 
327 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  46.3 
 
 
354 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  44.1 
 
 
330 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  45.4 
 
 
354 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  46.33 
 
 
325 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  46.01 
 
 
325 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  44.16 
 
 
330 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>