225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1153 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 334 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  96.41 
 
 		 335 aa  636    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  85.05 
 
 		 322 aa  548  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  77.56 
 
 		 322 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  77.56 
 
 		 322 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  77.56 
 
 		 322 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  51.07 
 
 		 328 aa  323  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  55.02 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  49.24 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  48.62 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  52.88 
 
 		 308 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  41.21 
 
 		 321 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  41.9 
 
 		 321 aa  282  7.000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  47.76 
 
 		 334 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  43.3 
 
 		 360 aa  280  2e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  46.53 
 
 		 331 aa  281  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  48.02 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  45.1 
 
 		 308 aa  279  6e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  47.71 
 
 		 344 aa  279  6e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  46.46 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  51.17 
 
 		 373 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  45.8 
 
 		 344 aa  272  5.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  47.32 
 
 		 334 aa  272  7e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  46.1 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  44.79 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  43.34 
 
 		 311 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  47.54 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  44 
 
 		 306 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  46.57 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  44.76 
 
 		 314 aa  260  3e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  43.83 
 
 		 311 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  44.81 
 
 		 330 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  43.41 
 
 		 312 aa  256  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  43.33 
 
 		 307 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  44.72 
 
 		 387 aa  252  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  46 
 
 		 314 aa  252  7e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  44.03 
 
 		 330 aa  252  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  43.52 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  42.28 
 
 		 400 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  40.88 
 
 		 354 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  42.6 
 
 		 333 aa  249  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  43.55 
 
 		 318 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  41.11 
 
 		 354 aa  248  7e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  40.35 
 
 		 354 aa  248  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  40.35 
 
 		 354 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  43.14 
 
 		 347 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  43.77 
 
 		 312 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  42.31 
 
 		 310 aa  246  4e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  43.37 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  41 
 
 		 311 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  42.72 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  39.07 
 
 		 343 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  41.57 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  39.14 
 
 		 399 aa  242  7.999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  40.94 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  42.72 
 
 		 327 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  41.72 
 
 		 330 aa  240  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  41.43 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  42.72 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  43.35 
 
 		 325 aa  238  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  43 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  40.45 
 
 		 317 aa  237  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  40.73 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  40.73 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  39.16 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  40.73 
 
 		 399 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  37.43 
 
 		 350 aa  236  6e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  42.99 
 
 		 334 aa  236  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  41.77 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  42.02 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  41.38 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  42.44 
 
 		 320 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  39.94 
 
 		 322 aa  234  2.0000000000000002e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  41.96 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  40.74 
 
 		 352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  44.59 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  38.68 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  41.04 
 
 		 317 aa  232  6e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  38.39 
 
 		 398 aa  232  8.000000000000001e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  40 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  42.52 
 
 		 317 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  44.21 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  44.16 
 
 		 334 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  41.09 
 
 		 338 aa  229  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  43.06 
 
 		 320 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  40.71 
 
 		 317 aa  229  6e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  39.88 
 
 		 329 aa  229  6e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  41.72 
 
 		 314 aa  229  6e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  42.76 
 
 		 327 aa  228  7e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  42 
 
 		 322 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  41.23 
 
 		 328 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  42.62 
 
 		 323 aa  228  1e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  40.92 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  42 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  42 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  42 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  41.67 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  42.11 
 
 		 320 aa  226  4e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  40.2 
 
 		 305 aa  226  4e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  42 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>