220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0942 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  100 
 
 
328 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  76.47 
 
 
329 aa  504  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  61.61 
 
 
327 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  60.86 
 
 
330 aa  390  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  59.33 
 
 
329 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  59.63 
 
 
325 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  59.63 
 
 
352 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  58.64 
 
 
327 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  59.57 
 
 
327 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  60.55 
 
 
347 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  61.18 
 
 
346 aa  360  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  57.51 
 
 
354 aa  356  1.9999999999999998e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  59.09 
 
 
330 aa  355  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  57.89 
 
 
354 aa  355  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  57.23 
 
 
354 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  59.26 
 
 
327 aa  354  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  57.49 
 
 
327 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  57.49 
 
 
327 aa  354  1e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  57.36 
 
 
325 aa  353  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  57.36 
 
 
325 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  57.06 
 
 
325 aa  351  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  56.35 
 
 
354 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  55.89 
 
 
328 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  55.89 
 
 
328 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  55.89 
 
 
328 aa  346  3e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  56.52 
 
 
354 aa  346  4e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  55.59 
 
 
328 aa  345  8e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  55.59 
 
 
328 aa  342  5e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  58.93 
 
 
324 aa  338  7e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  55.03 
 
 
329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  54.63 
 
 
344 aa  333  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  53.29 
 
 
339 aa  332  8e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  56.35 
 
 
334 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  54.24 
 
 
353 aa  322  4e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  54.35 
 
 
341 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  54.35 
 
 
341 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  55.25 
 
 
341 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  53.37 
 
 
341 aa  292  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  44.2 
 
 
329 aa  283  4.0000000000000003e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  46.75 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  48.87 
 
 
338 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  47.56 
 
 
359 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  43.87 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  45.23 
 
 
331 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  44.04 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  46.37 
 
 
318 aa  269  4e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  48.36 
 
 
314 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  43.32 
 
 
321 aa  264  1e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  45.29 
 
 
325 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  46.18 
 
 
325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  48.08 
 
 
323 aa  259  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  42.95 
 
 
317 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  41.37 
 
 
321 aa  255  6e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  46.3 
 
 
325 aa  255  6e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  44.87 
 
 
320 aa  251  8.000000000000001e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  42.95 
 
 
317 aa  250  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  42.41 
 
 
321 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  41.53 
 
 
308 aa  249  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  43.53 
 
 
316 aa  249  6e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
305 aa  248  1e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  41.32 
 
 
311 aa  247  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  42.27 
 
 
322 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  45.66 
 
 
308 aa  246  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  42.27 
 
 
322 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  42.27 
 
 
322 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  43.38 
 
 
317 aa  246  4e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  44.83 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  41.08 
 
 
328 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  43.08 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  41.4 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  42.68 
 
 
344 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  44.1 
 
 
320 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  41.77 
 
 
322 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  38.66 
 
 
311 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  41.46 
 
 
322 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  43.75 
 
 
320 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  41.93 
 
 
317 aa  237  2e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  37.46 
 
 
306 aa  236  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  41.16 
 
 
322 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  41.16 
 
 
322 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  40.75 
 
 
322 aa  236  4e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  38.8 
 
 
322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  41.16 
 
 
337 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  42.67 
 
 
335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  42.07 
 
 
344 aa  235  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  42.02 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  42.56 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.29 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  41.48 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  38.02 
 
 
311 aa  233  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  42.46 
 
 
321 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  45.83 
 
 
440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  42.15 
 
 
321 aa  232  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  42.15 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  42.15 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  42.51 
 
 
325 aa  232  7.000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  42.15 
 
 
321 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  42.15 
 
 
320 aa  231  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  42.15 
 
 
321 aa  231  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  42.15 
 
 
321 aa  231  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>