236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3366 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3366  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 440 aa  888    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.404586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  54.26 
 
 		 328 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  50.38 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  53.47 
 
 		 329 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  51.14 
 
 		 347 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  51.54 
 
 		 320 aa  256  8e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  54.75 
 
 		 346 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  53.81 
 
 		 327 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  49.4 
 
 		 311 aa  249  5e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  53.64 
 
 		 331 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  53.81 
 
 		 327 aa  249  7e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  53.81 
 
 		 327 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  49.41 
 
 		 354 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  52.52 
 
 		 313 aa  247  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  49.03 
 
 		 354 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  53.75 
 
 		 324 aa  246  8e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  50.83 
 
 		 314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  51.79 
 
 		 330 aa  244  3e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  47.15 
 
 		 354 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  50.62 
 
 		 354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 308 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4581  Integral membrane protein TerC  51.19 
 
 		 357 aa  243  5e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2152  integral membrane protein TerC  46.83 
 
 		 405 aa  243  7e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.305703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  46.27 
 
 		 321 aa  242  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  50.43 
 
 		 359 aa  242  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  55.66 
 
 		 321 aa  242  1e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  53.77 
 
 		 338 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  46.67 
 
 		 321 aa  241  2e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  47.45 
 
 		 312 aa  240  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  49.22 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  48.79 
 
 		 352 aa  239  6.999999999999999e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  45.88 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  48.56 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5754  Integral membrane protein TerC  48.45 
 
 		 354 aa  236  5.0000000000000005e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  50.63 
 
 		 320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  54.29 
 
 		 306 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  48.37 
 
 		 325 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  48.1 
 
 		 320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  51.63 
 
 		 330 aa  233  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  45.83 
 
 		 328 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  48.48 
 
 		 320 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  52.07 
 
 		 329 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  49.57 
 
 		 328 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  52.86 
 
 		 307 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  52.56 
 
 		 327 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  48.05 
 
 		 320 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  46.85 
 
 		 329 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  51.63 
 
 		 325 aa  230  5e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  51.63 
 
 		 327 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  51.63 
 
 		 327 aa  229  7e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 323 aa  229  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  51.63 
 
 		 325 aa  229  9e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  51.63 
 
 		 328 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  48.22 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  51.63 
 
 		 328 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  46.3 
 
 		 325 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  51.63 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  51.16 
 
 		 325 aa  228  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  50.47 
 
 		 311 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  48.71 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  51.16 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  45.53 
 
 		 354 aa  227  3e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  47.97 
 
 		 318 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  50.23 
 
 		 328 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  50.23 
 
 		 339 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  47.81 
 
 		 314 aa  226  6e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  51.18 
 
 		 335 aa  226  6e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  44.91 
 
 		 329 aa  226  7e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  46.5 
 
 		 311 aa  225  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  50.24 
 
 		 334 aa  225  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  47.37 
 
 		 305 aa  224  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  50.23 
 
 		 337 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  50.71 
 
 		 314 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  50.95 
 
 		 322 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  50.95 
 
 		 322 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  50.95 
 
 		 322 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  44.94 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  48.29 
 
 		 317 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  44.58 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  46.85 
 
 		 312 aa  221  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  46.1 
 
 		 339 aa  221  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  47.64 
 
 		 325 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  50.23 
 
 		 328 aa  220  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  44.71 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  52.43 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  44.96 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  50.24 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  51.9 
 
 		 313 aa  216  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  48.82 
 
 		 318 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  47.28 
 
 		 344 aa  216  9.999999999999999e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  49.51 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  46.09 
 
 		 344 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12759  predicted protein  44.9 
 
 		 275 aa  214  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.556022  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  50.48 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  49.03 
 
 		 321 aa  213  5.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  49.03 
 
 		 321 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  49.03 
 
 		 321 aa  212  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  48.29 
 
 		 317 aa  212  9e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  49.03 
 
 		 321 aa  212  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  49.03 
 
 		 321 aa  212  9e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>