224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2297 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 286 aa  561  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  61.87 
 
 		 279 aa  340  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  46.74 
 
 		 311 aa  265  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  47.81 
 
 		 328 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  47.83 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  45.62 
 
 		 310 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  47.48 
 
 		 321 aa  256  3e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  48.4 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  47.48 
 
 		 321 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  46.52 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  45.61 
 
 		 321 aa  253  3e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  45.61 
 
 		 321 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  46.4 
 
 		 308 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  45.61 
 
 		 320 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  45.61 
 
 		 321 aa  252  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  45.61 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  45.61 
 
 		 321 aa  252  5.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  45.74 
 
 		 314 aa  252  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  45.61 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  44.72 
 
 		 317 aa  251  8.000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  45.26 
 
 		 321 aa  250  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  46.32 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  45.61 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  45.45 
 
 		 325 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  44.12 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  45.16 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  44.95 
 
 		 323 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  45.49 
 
 		 311 aa  248  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  46.13 
 
 		 313 aa  247  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  45.68 
 
 		 312 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  43.21 
 
 		 313 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  43.31 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  48.75 
 
 		 317 aa  245  6.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  43.64 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  42.81 
 
 		 328 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  42.46 
 
 		 325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  43.31 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  43.31 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  43.31 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  42.81 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  42.81 
 
 		 328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  42.46 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  43.31 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  42.71 
 
 		 327 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  42.71 
 
 		 327 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  42.46 
 
 		 325 aa  242  5e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  44.52 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  40.62 
 
 		 320 aa  242  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  42.11 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  42.46 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  42.61 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  42.6 
 
 		 322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  43.11 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  44.17 
 
 		 318 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  43.66 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  43.59 
 
 		 320 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  45.82 
 
 		 305 aa  238  5.999999999999999e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  42.39 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  44.2 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  42.66 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  43.22 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  44.84 
 
 		 321 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  44.8 
 
 		 325 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  43.36 
 
 		 322 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  43.31 
 
 		 325 aa  232  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  40.88 
 
 		 328 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  44.6 
 
 		 334 aa  229  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  40.51 
 
 		 328 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  42.11 
 
 		 319 aa  229  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  38.51 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  45.85 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  43.6 
 
 		 318 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  43.43 
 
 		 324 aa  226  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  41.94 
 
 		 352 aa  226  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  39.93 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  46.88 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  46.88 
 
 		 346 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  42.07 
 
 		 359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  43.07 
 
 		 338 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  39.24 
 
 		 315 aa  223  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  43.11 
 
 		 354 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  45.57 
 
 		 314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  41.43 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  40.43 
 
 		 334 aa  219  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  43.42 
 
 		 354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  42.6 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  44.49 
 
 		 354 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  40.42 
 
 		 330 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  43.26 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  44.02 
 
 		 328 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  39.13 
 
 		 330 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  38.23 
 
 		 332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  39.01 
 
 		 360 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  37.25 
 
 		 332 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  44.58 
 
 		 318 aa  216  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  41.58 
 
 		 320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  38.29 
 
 		 335 aa  214  9e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  37.72 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  37.72 
 
 		 322 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.05 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>