234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_33470 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_33470  Integral membrane protein TerC family  100 
 
 
324 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  70.81 
 
 
327 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  70.81 
 
 
327 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  72.27 
 
 
327 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10570  Integral membrane protein TerC family  75.16 
 
 
334 aa  441  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  69.57 
 
 
330 aa  434  1e-121  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  64.92 
 
 
354 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  67.6 
 
 
347 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  67.6 
 
 
346 aa  419  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  64 
 
 
354 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  64.09 
 
 
354 aa  411  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  63.69 
 
 
354 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  61.44 
 
 
329 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  62.27 
 
 
329 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  58.62 
 
 
327 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  61.83 
 
 
325 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  61.99 
 
 
325 aa  368  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  62.31 
 
 
327 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  62.31 
 
 
327 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  62.31 
 
 
325 aa  369  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  61.68 
 
 
325 aa  366  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  58.93 
 
 
328 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  61.49 
 
 
328 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  61.49 
 
 
328 aa  365  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  56.33 
 
 
339 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  61.18 
 
 
328 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  61.18 
 
 
328 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  58.13 
 
 
329 aa  362  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  59.44 
 
 
328 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  58.62 
 
 
330 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  55.77 
 
 
354 aa  340  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  57.23 
 
 
352 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0806  Integral membrane protein TerC  53.7 
 
 
353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0840  Integral membrane protein TerC  53.09 
 
 
341 aa  318  7e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.251976  hitchhiker  0.00983722 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0880  integral membrane protein TerC  53.09 
 
 
341 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2008  integral membrane protein TerC  52.83 
 
 
344 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0222851 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4372  integral membrane protein TerC  55.17 
 
 
341 aa  311  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18139  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4912  Integral membrane protein TerC  53.11 
 
 
341 aa  290  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0595936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  48.53 
 
 
329 aa  288  7e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  49.84 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  45.1 
 
 
337 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  49.67 
 
 
359 aa  276  3e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  47.39 
 
 
328 aa  276  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  44.51 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  44.89 
 
 
331 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  49.33 
 
 
314 aa  265  8e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  44.79 
 
 
317 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  49.67 
 
 
334 aa  259  6e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  48.04 
 
 
325 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  47.5 
 
 
325 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  43.62 
 
 
321 aa  255  8e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  44.79 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  44.87 
 
 
328 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  42.9 
 
 
321 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  47.3 
 
 
325 aa  252  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  43.52 
 
 
321 aa  252  8.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  43.91 
 
 
328 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  46.54 
 
 
320 aa  248  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  43.41 
 
 
317 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  47.76 
 
 
344 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  47.23 
 
 
323 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  46.73 
 
 
318 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  44.98 
 
 
308 aa  245  6e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  45.54 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  43.99 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  45.69 
 
 
335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  43.15 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
317 aa  243  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  45.57 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  45.39 
 
 
318 aa  242  6e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  45.05 
 
 
334 aa  242  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  45.72 
 
 
313 aa  241  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  40.89 
 
 
311 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  45.05 
 
 
322 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  43.13 
 
 
316 aa  239  5e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  45.1 
 
 
328 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  44.44 
 
 
322 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  44.44 
 
 
322 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  44.44 
 
 
322 aa  237  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  38.54 
 
 
311 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  43 
 
 
322 aa  235  8e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  43.71 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  43.71 
 
 
321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  43.71 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  43.71 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  44.16 
 
 
321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  45.81 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  43.71 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  43.71 
 
 
321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  43.71 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  44.16 
 
 
321 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  43.09 
 
 
318 aa  232  5e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  44.48 
 
 
322 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  38.31 
 
 
310 aa  231  9e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  42.21 
 
 
312 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  40.55 
 
 
306 aa  231  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  39.2 
 
 
311 aa  230  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  40.69 
 
 
305 aa  231  2e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  44.16 
 
 
322 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  42.77 
 
 
320 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>