100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_4154 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  66.41 
 
 
268 aa  362  2e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  65.61 
 
 
253 aa  352  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  63.24 
 
 
252 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  60.47 
 
 
258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  58.1 
 
 
249 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  57.77 
 
 
266 aa  318  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  58.57 
 
 
260 aa  317  1e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  58.17 
 
 
266 aa  315  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  58.57 
 
 
267 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  58.17 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  58.57 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  58.17 
 
 
267 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  57.37 
 
 
266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  58.43 
 
 
253 aa  310  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  56.18 
 
 
266 aa  310  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  47.84 
 
 
254 aa  249  4e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  44.06 
 
 
258 aa  224  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  44.49 
 
 
256 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  41.11 
 
 
255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  40.74 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  40.5 
 
 
258 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  41.13 
 
 
256 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  37.79 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  37.83 
 
 
266 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  38.34 
 
 
263 aa  186  5e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  40.8 
 
 
261 aa  184  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  37.23 
 
 
275 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  39.22 
 
 
248 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  39.61 
 
 
248 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  39.22 
 
 
248 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  39.92 
 
 
248 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  39.51 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  35.44 
 
 
284 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  35.8 
 
 
254 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  35.37 
 
 
249 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  37.5 
 
 
319 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  35.97 
 
 
285 aa  163  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  37.6 
 
 
272 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  37.11 
 
 
266 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  37.25 
 
 
248 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  35.69 
 
 
271 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  35.69 
 
 
271 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  34.9 
 
 
272 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  36.33 
 
 
250 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  38 
 
 
248 aa  155  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  36.08 
 
 
251 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  34.51 
 
 
255 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  33.74 
 
 
318 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  36.95 
 
 
250 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  40.25 
 
 
273 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  37.21 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  38.04 
 
 
281 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  38.04 
 
 
281 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  38.04 
 
 
281 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  37.45 
 
 
281 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  37.45 
 
 
281 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  36.76 
 
 
281 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  35.06 
 
 
283 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  35.06 
 
 
283 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  35.06 
 
 
283 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  35.06 
 
 
283 aa  142  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  35.06 
 
 
283 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  35.06 
 
 
283 aa  142  5e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  35.62 
 
 
283 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  36.65 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  34.27 
 
 
267 aa  138  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  32.92 
 
 
256 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  36.15 
 
 
257 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  34.13 
 
 
285 aa  133  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  33.33 
 
 
281 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  31.89 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  34.73 
 
 
295 aa  129  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  34.51 
 
 
274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  30.88 
 
 
294 aa  118  9e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  33.73 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  29.44 
 
 
232 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  29.06 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0880  protein of unknown function DUF833  33.74 
 
 
179 aa  81.3  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  28.63 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  29.31 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  29.74 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  28.16 
 
 
277 aa  79  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5931  hypothetical protein  36.91 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.0182438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  33.56 
 
 
246 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  25.97 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  37.1 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  33.73 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  29.31 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  26.74 
 
 
247 aa  68.9  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1833  hypothetical protein  28.22 
 
 
273 aa  68.6  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  31.65 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26585  predicted protein  23.58 
 
 
406 aa  65.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57105  predicted protein  42.67 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.669873 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  31.3 
 
 
300 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  30.69 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2286  protein of unknown function DUF833  31.74 
 
 
262 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000585883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  31.3 
 
 
265 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00340  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 
331 aa  55.8  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12188  hypothetical protein  29.03 
 
 
240 aa  49.3  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>