96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2266 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  100 
 
 
281 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  90.46 
 
 
285 aa  517  1e-146  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  73.55 
 
 
273 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  65.14 
 
 
281 aa  369  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  65.14 
 
 
281 aa  368  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  65.16 
 
 
281 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  65.85 
 
 
281 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  64.46 
 
 
281 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  65.16 
 
 
281 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  63.73 
 
 
281 aa  359  3e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  63.86 
 
 
283 aa  348  8e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  63.03 
 
 
283 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  63.03 
 
 
283 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  63.03 
 
 
283 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  63.03 
 
 
283 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  63.03 
 
 
283 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  63.03 
 
 
283 aa  344  8.999999999999999e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  46.62 
 
 
275 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  46.69 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  49.18 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  44.89 
 
 
248 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  47.33 
 
 
248 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  42.51 
 
 
263 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  44.69 
 
 
248 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  45.05 
 
 
284 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  44.16 
 
 
248 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  44.16 
 
 
248 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  43.7 
 
 
256 aa  178  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  42.25 
 
 
319 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  46.37 
 
 
271 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  39.77 
 
 
269 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  45.27 
 
 
248 aa  175  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  44.98 
 
 
272 aa  175  8e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  45.97 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  40.75 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  38.77 
 
 
255 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  46.12 
 
 
254 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  41.94 
 
 
261 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  47.33 
 
 
250 aa  171  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  44 
 
 
256 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  46.75 
 
 
266 aa  169  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  41.22 
 
 
249 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  46.91 
 
 
251 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  42.21 
 
 
258 aa  166  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  44.21 
 
 
258 aa  163  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  39.42 
 
 
260 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  40.8 
 
 
258 aa  155  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  42.22 
 
 
318 aa  154  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  38.4 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  37.9 
 
 
249 aa  152  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  37.6 
 
 
266 aa  150  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  37.6 
 
 
266 aa  148  9e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  37.96 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  36.24 
 
 
260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  37.19 
 
 
266 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  39.26 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  37.55 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  37.1 
 
 
267 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  37.1 
 
 
267 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  37.1 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  37.1 
 
 
267 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  36.4 
 
 
253 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  36.86 
 
 
258 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  36.64 
 
 
295 aa  137  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  36.19 
 
 
254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  41.11 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  39.22 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  33.33 
 
 
258 aa  132  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  37.15 
 
 
272 aa  124  2e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  36.09 
 
 
250 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  34.78 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  31.87 
 
 
274 aa  119  7.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  32.51 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  34.84 
 
 
248 aa  115  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  38.8 
 
 
255 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  30.18 
 
 
278 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0880  protein of unknown function DUF833  33.14 
 
 
179 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  32.93 
 
 
232 aa  82  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26585  predicted protein  30.62 
 
 
406 aa  72.8  0.000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  33.85 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06058  DUF833 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09530)  31.5 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.695721 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  36.15 
 
 
244 aa  59.7  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00340  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 
331 aa  57.8  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  35.34 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  38.64 
 
 
239 aa  53.1  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  29.39 
 
 
249 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  30.12 
 
 
252 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  28.7 
 
 
249 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  28.7 
 
 
249 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  34.31 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  37.12 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  30.2 
 
 
277 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57105  predicted protein  29.86 
 
 
339 aa  46.2  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.669873 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  37.93 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  29.61 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12188  hypothetical protein  26.01 
 
 
240 aa  43.5  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>