100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3748 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  67.73 
 
 		 253 aa  378  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  70.16 
 
 		 252 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  66.41 
 
 		 258 aa  362  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  60.15 
 
 		 267 aa  345  4e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  60.15 
 
 		 267 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  60.15 
 
 		 267 aa  345  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  61.6 
 
 		 260 aa  343  1e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  59.77 
 
 		 267 aa  343  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  59.38 
 
 		 266 aa  339  4e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  57.85 
 
 		 266 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  57.47 
 
 		 266 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  56.7 
 
 		 266 aa  333  1e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  59.68 
 
 		 253 aa  315  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  59.2 
 
 		 249 aa  310  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  57.2 
 
 		 258 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  50 
 
 		 254 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  46.09 
 
 		 256 aa  231  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  41.86 
 
 		 260 aa  214  8e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  44 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  41.34 
 
 		 255 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  43.31 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  42.08 
 
 		 258 aa  201  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  41.29 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  43.55 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  43.51 
 
 		 258 aa  194  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  39.92 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  41.2 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  38.78 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  39.37 
 
 		 254 aa  175  9e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  41.3 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  41.3 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  39.68 
 
 		 248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  39.29 
 
 		 275 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  40.33 
 
 		 319 aa  169  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  39.43 
 
 		 248 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  40.49 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  40.4 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  34.78 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  35.18 
 
 		 272 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  34.78 
 
 		 271 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  35.58 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  41.25 
 
 		 283 aa  159  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  40.24 
 
 		 250 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  37.4 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  41.3 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  41.3 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  41.3 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  38.89 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  41.3 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  41.3 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  41.3 
 
 		 283 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  36.9 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  40.17 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  38.62 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  37.86 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  40.51 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  40.51 
 
 		 281 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  34.5 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  38.82 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  38.82 
 
 		 281 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  38.82 
 
 		 281 aa  148  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  39.26 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  39.24 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  39.24 
 
 		 281 aa  145  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  38.71 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  35.8 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  36.86 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  34.25 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  35.02 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  34.17 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  33.2 
 
 		 274 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  31.25 
 
 		 256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  36 
 
 		 257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  33.73 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  29.43 
 
 		 294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  30.08 
 
 		 232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  28.93 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  29.91 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  29.49 
 
 		 249 aa  83.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  30.6 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  32.92 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  29 
 
 		 252 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0880  protein of unknown function DUF833  30.18 
 
 		 179 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  35.37 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5931  hypothetical protein  34.01 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.0182438 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  33.77 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1833  hypothetical protein  28.98 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  30.57 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  27.75 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  29.94 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57105  predicted protein  39 
 
 		 339 aa  67  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.669873 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  29.44 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  32.03 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00340  conserved hypothetical protein  29.96 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  31.35 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  31.82 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2286  protein of unknown function DUF833  31.52 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000585883  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26585  predicted protein  23.08 
 
 		 406 aa  49.7  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12188  hypothetical protein  31.2 
 
 		 240 aa  45.8  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>