84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1537 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  100 
 
 		 270 aa  526  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1833  hypothetical protein  51.44 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5931  hypothetical protein  43.35 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.0182438 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  42.22 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2286  protein of unknown function DUF833  39.33 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000585883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  38.55 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  36.5 
 
 		 258 aa  106  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  39.71 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  36.78 
 
 		 239 aa  97.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  29.18 
 
 		 277 aa  79  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1704  hypothetical protein  39.62 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  37.72 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  35.88 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  37.13 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  29.28 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  33.73 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  30.91 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  36.22 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  30.54 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  26.83 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  30.54 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  41.86 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  30.54 
 
 		 266 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  31.35 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  35.67 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  34.29 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  29.34 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  39.39 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  31.14 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  31.14 
 
 		 267 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  31.14 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  33.33 
 
 		 248 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  26.34 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  35.33 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  28.85 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  35.03 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  29.59 
 
 		 260 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  36.84 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  30.54 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  35.03 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  44.9 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  34.97 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  50 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  35.66 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  42.86 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  36.84 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  29.7 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  45.71 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  34.59 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  44.29 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  37.86 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  45.71 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  39.39 
 
 		 260 aa  54.7  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  35.15 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  40 
 
 		 263 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  35.2 
 
 		 252 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  44.29 
 
 		 256 aa  52.8  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  44.29 
 
 		 266 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  28.8 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  35.21 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  33.92 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  28.03 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  34.88 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  38.57 
 
 		 232 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  33.92 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  32.89 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  31.41 
 
 		 283 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  29.76 
 
 		 278 aa  46.2  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  32.97 
 
 		 273 aa  45.8  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  32.14 
 
 		 300 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  41.1 
 
 		 319 aa  45.4  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  43.06 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  31.39 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  37.93 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  41.24 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12188  hypothetical protein  25.29 
 
 		 240 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.910212  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  32.69 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  32.69 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  32.69 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  32.69 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  32.69 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  32.69 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  34.65 
 
 		 250 aa  43.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  29.1 
 
 		 281 aa  42  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>