101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0721 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0721  protein of unknown function DUF833  100 
 
 		 258 aa  520  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00144425  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0734  protein of unknown function DUF833  93 
 
 		 258 aa  486  1e-136  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000353958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0792  hypothetical protein  57.08 
 
 		 256 aa  265  7e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0231  hypothetical protein  52.46 
 
 		 261 aa  241  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0589  hypothetical protein  49.37 
 
 		 263 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2245  hypothetical protein  47.3 
 
 		 269 aa  235  6e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1205  protein of unknown function DUF833  50.2 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4017  hypothetical protein  44.49 
 
 		 255 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.312319  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0026  hypothetical protein  47.41 
 
 		 254 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01011  hypothetical protein  42.74 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0890099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4216  hypothetical protein  49 
 
 		 248 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5051  hypothetical protein  47.26 
 
 		 248 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0321  hypothetical protein  46.84 
 
 		 248 aa  211  7e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.839097  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5144  hypothetical protein  47.26 
 
 		 248 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142216  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4437  hypothetical protein  42.74 
 
 		 253 aa  208  6e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.120022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5197  hypothetical protein  45.28 
 
 		 248 aa  208  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2506  protein of unknown function DUF833  46.37 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.367832  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5376  hypothetical protein  44.22 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0593  protein of unknown function DUF833  45.15 
 
 		 250 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4830  hypothetical protein  42.5 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1832  hypothetical protein  46.01 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00869889  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4154  hypothetical protein  40.74 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2200  hypothetical protein  44.73 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1430  hypothetical protein  45.45 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.09598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3748  hypothetical protein  43.55 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000326154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3629  hypothetical protein  42.32 
 
 		 253 aa  193  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1255  hypothetical protein  46.56 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0129469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0121  hypothetical protein  40.74 
 
 		 266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0116  hypothetical protein  41.15 
 
 		 266 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.20644 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0121  hypothetical protein  41.56 
 
 		 266 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0375691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0432  hypothetical protein  44.22 
 
 		 251 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0122525  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0121  hypothetical protein  40.08 
 
 		 267 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4233  hypothetical protein  39.68 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0126  hypothetical protein  39.68 
 
 		 267 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1780  putative signal peptide protein  45.28 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000400894  normal  0.836293 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0125  protein of unknown function DUF833  39.68 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0043  hypothetical protein  40.5 
 
 		 249 aa  185  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1429  protein of unknown function DUF833  44.88 
 
 		 271 aa  185  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1470  protein of unknown function DUF833  44.88 
 
 		 271 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0397619 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0090  hypothetical protein  40.42 
 
 		 258 aa  183  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04430  hypothetical protein  43.43 
 
 		 251 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0122  hypothetical protein  39.52 
 
 		 260 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0645812  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0126  hypothetical protein  40.16 
 
 		 266 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48200  hypothetical protein  47.68 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1696  protein of unknown function DUF833  42.04 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000187998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1867  hypothetical protein  37.24 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1330  hypothetical protein  40 
 
 		 266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480841  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0969  hypothetical protein  38.17 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.60862  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2446  hypothetical protein  45.89 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1919  hypothetical protein  45.89 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3385  hypothetical protein  45.89 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.184689  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2284  hypothetical protein  45.89 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0642523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2323  hypothetical protein  45.89 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.200076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1192  hypothetical protein  45.89 
 
 		 283 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.539326  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1919  hypothetical protein  46.79 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.303193 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6183  hypothetical protein  46.79 
 
 		 281 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1896  hypothetical protein  46.79 
 
 		 281 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2151  hypothetical protein  45.45 
 
 		 283 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1805  hypothetical protein  44.95 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0126825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1936  protein of unknown function DUF833  43.15 
 
 		 285 aa  164  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751101  normal  0.504392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1833  hypothetical protein  44.5 
 
 		 281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2266  putative signal peptide protein  44.21 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.591807  normal  0.166947 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1378  hypothetical protein  45.41 
 
 		 281 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5196  hypothetical protein  45.41 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1040  hypothetical protein  40.77 
 
 		 273 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.285411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2435  hypothetical protein  38.85 
 
 		 272 aa  156  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2575  hypothetical protein  41.42 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2166  protein of unknown function DUF833  40.42 
 
 		 256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.454484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2522  hypothetical protein  39.33 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0545504  hitchhiker  0.00352676 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1864  hypothetical protein  39.44 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0989733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4674  hypothetical protein  38.19 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0226025  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1874  hypothetical protein  38.24 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0793427 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04376  hypothetical protein  38.08 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.982217  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2311  hypothetical protein  33.08 
 
 		 274 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.986633 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2329  hypothetical protein  35.25 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465577 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2009  hypothetical protein  31.16 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0266  hypothetical protein  33.46 
 
 		 232 aa  118  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0880  protein of unknown function DUF833  43.52 
 
 		 179 aa  89.7  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4738  protein of unknown function DUF833  32.11 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00340  conserved hypothetical protein  31.6 
 
 		 331 aa  84.3  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57105  predicted protein  25.31 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.669873 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26585  predicted protein  32.02 
 
 		 406 aa  82  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0180  protein of unknown function DUF833  31.07 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0425571  normal  0.150181 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3804  hypothetical protein  31.51 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0378562 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3553  protein of unknown function DUF833  33.59 
 
 		 300 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.969524  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3020  hypothetical protein  32.16 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.401394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3735  protein of unknown function DUF833  28.88 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.451552  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3818  protein of unknown function DUF833  28.88 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3677  hypothetical protein  29 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06058  DUF833 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09530)  32.37 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.695721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1537  protein of unknown function DUF833  45.71 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0713  hypothetical protein  36.78 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1772  protein of unknown function DUF833  36.67 
 
 		 265 aa  52.8  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1833  hypothetical protein  26.73 
 
 		 273 aa  52.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4630  protein of unknown function DUF833  29.75 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.057436 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2318  protein of unknown function DUF833  26.81 
 
 		 244 aa  52.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.371027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5931  hypothetical protein  40.85 
 
 		 238 aa  52.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213112  normal  0.0182438 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0796  protein of unknown function DUF833  32.54 
 
 		 277 aa  51.2  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.985351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1933  hypothetical protein  38.37 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.355532 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2286  protein of unknown function DUF833  38.57 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000585883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>